Thuật toán tìm kiếm cơ sở dữ liệu lý thuyết số liệu


9

Tôi (từ từ) viết một bài đánh giá về Sổ tay thuật toán hóa học hóa học cho SIGACT News. Một chương thảo luận về việc triển khai phần mềm hiện tại và các tìm kiếm cơ sở dữ liệu (và các ứng dụng khác) dường như không tận dụng được nhiều thông tin về biểu đồ nhất có thể. Mặt khác, có lẽ nhiều thuật toán lý thuyết sẽ quá khó để thực hiện. Có vẻ như một khu vực mở tiềm năng, mặc dù.

Vì vậy, đây là câu hỏi của tôi:

Có một cái nhìn tổng quan (hoặc một số ít tài liệu tham khảo) thảo luận về lý thuyết và thực hiện (hy vọng) các thuật toán của cơ sở dữ liệu đồ thị với thông tin số liệu? (Mỗi cạnh là một khoảng cách và mỗi đỉnh có một thể tích.) Một mô tả không có hóa học về một vấn đề mẫu sẽ là: đưa ra một cơ sở dữ liệu về đồ thị, tìm tất cả chúng có chứa một sơ đồ con cụ thể.


cơ sở dữ liệu có thông tin số liệu quan trọng đến mức nào? Có hàng tấn công việc tìm kiếm cơ sở dữ liệu đồ thị, ngay cả trong lĩnh vực sinh học, nhưng tôi không biết về vấn đề nhãn khối lượng / khoảng cách
Suresh Venkat

Tôi sẽ biết câu trả lời cho câu hỏi của bạn trong một hoặc hai tuần. Những điểm tương đồng và khác biệt với các vấn đề tin sinh học đối với tôi vẫn chưa rõ ràng.
Aaron Sterling

Câu trả lời:


2

Điều này dường như có liên quan đến vấn đề đẳng cấu đồ thị con nói chung là hoàn thành NP, thậm chí không có bất kỳ trọng số nào. Bài viết Wikipedia tương ứng tuyên bố rằng nó có thể được giải quyết hiệu quả trong một số trường hợp nhất định.

Nếu hóa học là bất cứ thứ gì giống như tin sinh học, có lẽ bạn sẽ quan tâm đến các thuật toán gần đúng để xử lý nhiễu, dù sao đi nữa. Ngoài ra, được cung cấp tra cứu cơ sở dữ liệu dưới dạng ứng dụng, có thể có những ý tưởng thông minh cho quá trình tiền xử lý cung cấp cho bạn thời gian khấu hao tốt.

Tìm thấy (không đọc) những người:

http://www.springerlink.com/content/4751121q3575v041/

http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/23/2/232.full

http://portal.acm.org/cites.cfm?id=1368898

Tuyên bố từ chối trách nhiệm : Một lần nữa, xin lỗi vì câu trả lời kiểu bình luận; Tôi chưa được phép bình luận.

Khi sử dụng trang web của chúng tôi, bạn xác nhận rằng bạn đã đọc và hiểu Chính sách cookieChính sách bảo mật của chúng tôi.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.