Một số vấn đề trong lĩnh vực sinh học tính toán có vẻ phù hợp cho các ứng dụng thực tế không phải là nhân tạo - hoặc ít nhất là không nhân tạo như các vấn đề được đề cập bởi Jukka Suomela.
Chẳng hạn, mọi người thường đề cập đến công trình của F. Abu-Khzam, R. Collins, M. Fellows, M. Langston, W. Suting C. Symons, Thuật toán hạt nhân cho vấn đề vỏ bọc của Vertex: Lý thuyết và thí nghiệm , Kỷ yếu thứ 6 Hội thảo về Kỹ thuật và Thí nghiệm Thuật toán (ALENEX), ACM / SIAM, Proc. Toán ứng dụng 115, 2004.
Như các tác giả nêu rõ, "Một trong những ứng dụng mà chúng tôi đã áp dụng các phương pháp của mình liên quan đến việc tìm cây phát sinh gen dựa trên thông tin miền protein, ..." (phần 8 của bài viết trên).
Một tập hợp con của các tác giả có các bài viết tương tự về chủ đề này, xem, ví dụ, Faisal N. Abu-Khzam, Michael A. Langston, Pushkar Shanbhag và Christopher T. Symons, Thuật toán song song có thể mở rộng cho các vấn đề của FPT , Thuật toán, Tập 45, Số 3 , 269-284.
Tôi không chắc liệu các thể hiện được sử dụng trong các thử nghiệm là các thể hiện trong thế giới thực hay nhân tạo, nhưng tôi hy vọng hai tài liệu tham khảo cung cấp cho bạn một điểm khởi đầu tốt.