Sau một hồi vật lộn, tôi tìm thấy thông tin này:
1) Shoebox là một ứng dụng lấy bản đồ như tôi đã liệt kê trong câu hỏi và cố gắng giải nén Sprites , điển hình là toàn bộ địa hình


2) Điều tôi muốn làm tiếp theo là chia hình ảnh này thành 9 ô và có thể ghép lại chúng theo nhiều cách khác nhau. Shoebox dường như cũng có thể làm điều này ( Extract Tiles ). Điều này tạo ra một tệp TMX

3) Dường như bước tiếp theo là nhập bản đồ .TMX kết quả vào trình chỉnh sửa bản đồ ô vuông , như Tiled: http://www.mopeditor.org/doad.html . Từ video, có vẻ như tôi sẽ có thể sắp xếp lại các ô và tạo các kết hợp khác nhau mà tôi cần.
Dường như ShoeBox có một lỗi trên mac khi nó gắn tên thư mục trước tên tệp png (Dòng 4) trong tệp TMX, vì vậy tôi phải xóa thủ công:
name="[REMOVE FOLDER]base_....

Danh sách các khung hỗ trợ bản đồ TMX: https://github.com/bjorn/tiled/wiki/Support-for-TMX-maps