Phần mềm nào tốt để sử dụng để gỡ lỗi song song?

Tôi hiện không chạy bất kỳ mã song song nào, nhưng tôi dự đoán sẽ chạy mã song song trong tương lai bằng cách sử dụng kết hợp OpenMP và MPI. Trình gỡ lỗi đã là công cụ vô giá đối với tôi khi chạy các dự án nối tiếp.

Bất cứ ai cũng có thể đề xuất một trình gỡ lỗi song song (hoặc nhiều trình gỡ lỗi) để sử dụng để gỡ lỗi phần mềm song song? Phần mềm miễn phí sẽ được ưa thích hơn, nhưng đừng ngần ngại đề cập đến phần mềm thương mại hiệu quả.

Về cơ bản có hai lựa chọn chính, thương mại: DDT từ Allinea (đó là những gì chúng tôi sử dụng tại TACC ) và Totalview (như đã đề cập trong bình luận khác). Chúng có các tính năng tương đương, đều được phát triển tích cực và là đối thủ cạnh tranh trực tiếp.

Eclipse có Nền tảng công cụ song song của họ , bao gồm hỗ trợ lập trình MPI và OpenMP và trình gỡ lỗi song song.

Tôi phải đưa ra câu trả lời curmudgeon. Năng suất của tôi chưa bao giờ được cải thiện bởi bất kỳ đề xuất nào ở trên. Chúng chậm và đắt so với tùy chọn ưa thích của tôi song song: một phiên gdb cho mỗi quy trình. Mỗi gdb có thể kết nối với một quy trình MPI và ngồi trong một xterm (điều này tự động xảy ra trong PETSc sử dụng -start_in_debugger). Tôi đã sử dụng điều này trong 15 năm, hạnh phúc. Phản đối:

1) Tôi không thể nhìn vào dữ liệu toàn cầu

Vì MPI là mô hình không chia sẻ, không có dữ liệu toàn cầu, chỉ có dữ liệu cục bộ

2) Chiến lược này không mở rộng ra nhiều quy trình

Không làm lỗi. Lỗi xảy ra trên các quy trình riêng lẻ, có thể với đầu vào từ 1 hoặc 2 hàng xóm. YOu có thể dễ dàng sinh ra gdb chỉ trên các quy trình tham gia ( -debugger_nodes 0,5,17ví dụ trong PETSc bạn sử dụng ). Ngoài ra, các hệ thống trên bỏ rất nhiều khi chạy trên mọi quy trình, khiến chúng chậm. Phương thức gdb trên thực tế có khả năng mở rộng hơn nhiều.

gdb cũng rất di động. Nó chạy ở mọi nơi, hiểu C ++ và Fortran và cho phép bạn thực thi mã tùy ý trong khi chạy. Tôi đã viết các chức năng đặc biệt để dễ dàng hiển thị dữ liệu khi chạy trong đó.

Tôi chỉ sử dụng hai trình gỡ lỗi cho các chương trình nối tiếp và song song:

1. Trình gỡ lỗi Kernighan, tức là các bản in hợp lý và suy nghĩ cẩn thận.
2. Nhiều phiên bản của GDB như được mô tả o http://www.open-mpi.org/faq/?carget=debugging#serial-debuggers .

Trong trường hợp (2) không đủ khả năng mở rộng, tôi tham khảo (1b).

Có Intel Parallel Studio bao gồm trình gỡ lỗi song song. Tôi chưa bao giờ làm việc với nó nhưng tôi đã thấy nó được sử dụng trong một vài bản demo. Đây là một video hướng dẫn cho thấy một số tính năng.

Tôi cũng đã thấy một vài hàm bao quanh gdb hoạt động khá tốt trong một số trường hợp nhất định.

Tổng quan . Đó là một trình gỡ lỗi thương mại. Rất dễ dàng để xem ngăn xếp trên mỗi bộ xử lý. Bạn có thể thấy các giá trị biến (và thay đổi chúng) trên các bộ xử lý / luồng. Bạn có thể vẽ các vectơ hoặc matracies để trực quan hóa các giá trị biến. Rõ ràng kịch bản cũng có thể (Tk / Tcl), để phân tích điểm đồng hồ tinh vi, mặc dù tôi chưa bao giờ làm việc với điều này.

Đối với một vài cách đơn giản để gỡ lỗi mã song song, chúng tôi đã thu thập một vài câu trả lời trong thỏa thuận.II Câu hỏi thường gặp trong phần gỡ lỗi: https://github.com/dealii/dealii/wiki/Frequently-Asked-Questions#debugging -dealii-ứng dụng

Tôi tự hỏi tại sao không ai nhắc đến Padb (Trình gỡ lỗi ứng dụng song song) là phần mềm mở và phần mềm miễn phí như OP thích, nhưng không mạnh như các đối tác thương mại, ví dụ: TotalView cho HPC

Đây là bản tóm tắt một số câu trả lời được đưa ra cho tôi trước đây:

OpenMP có chức năng định thời: omp_get_wtime()và omp_get_wtick()- tài liệu trực tuyến

Google có một hồ sơ CPU

Có Scalasca thực hiện hồ sơ và phân tích OpenMP và MPI

Sau đó, có Tau và vtune mà tôi chưa sử dụng.

Chúc may mắn!