Có một rủi ro lớn trong việc vận hành một hệ thống đã bị nhiễm và "đã" được dọn sạch virus. Rất nhiều trojan hiện đại có thói quen được lập trình vào chúng cho phép tải xuống phần mềm độc hại bổ sung. Đôi khi các lập trình viên của các loại virus khác thậm chí sử dụng các cửa hậu được mở bằng phần mềm độc hại để phát tán trojan của họ.
Nếu bạn đang sử dụng máy tính của mình cho bất cứ điều gì khác ngoài việc lướt internet đơn giản (Bạn sẽ làm gì khi đăng nhập vào trang web này). Tôi rất khuyên bạn nên định dạng ổ cứng của bạn. Nếu bạn sử dụng eBay, Amazon, ngân hàng trực tuyến hoặc chia sẻ mật khẩu và tên người dùng của bạn trên nhiều trang web thì đây là rủi ro tôi sẽ không gặp phải. Máy tính của bạn có thể đã bị lây nhiễm bởi một rootkit đã bị phát hiện bởi phần mềm được cài đặt trên máy tính của bạn.
Ngay cả khi bạn đang sử dụng đĩa CD trực tiếp để quét hệ thống của mình, bạn có thể bị nhiễm vi-rút mà hệ thống không tìm thấy. Sao lưu dữ liệu của bạn và tự mình làm và cài đặt một hệ thống không có vi-rút mới. Nếu bạn có bản sao lưu (mà bạn có thể không có), việc này sẽ mất ít hơn hai giờ.