Hai tôi có thể nghĩ ra; tốc độ và khả năng phục hồi lỗi.
Truy cập thông qua ổ đĩa ảo được gắn ISO chắc chắn sẽ chậm hơn so với truy cập trực tiếp vào các tệp. Để mở các ảnh đơn lẻ trong trình xem thì có lẽ nó sẽ không được chú ý.
Theo như các lỗi xảy ra, bất kỳ lỗi nào đối với tệp ISO cũng có thể khiến toàn bộ lô không thể truy cập được. Tất nhiên, hầu hết các lỗi ổ cứng sẽ nghiêm trọng hơn nhiều so với một ít dữ liệu bị hỏng, không thể khôi phục được, nhưng giả sử bạn có một số lượng nhỏ tham nhũng trên đĩa.
Với các thư mục chứa các tệp riêng lẻ, điều này sẽ chỉ để lại bất kỳ tệp nào trong đó dữ liệu bị hỏng là không thể đọc được (không thể mở dưới dạng hình ảnh).
Tuy nhiên, cùng một lỗi dữ liệu nhỏ ở bất kỳ đâu trong tệp ISO rất có thể sẽ khiến toàn bộ ảnh ISO không thể gắn kết và do đó không thể đọc được.
Tuy nhiên, nếu bạn cũng đã sử dụng ISO để ghi đĩa sao lưu được giữ an toàn trong ngăn kéo ở đâu đó thì điều đó không thành vấn đề (và dù sao cũng không thể xảy ra với các ổ đĩa hiện đại).