Phân tích không gian và phân cụm các tính năng gần


11

Tôi đang làm việc về việc đánh dấu hành vi ở động vật sống theo nhóm và tôi quan tâm đến việc hành vi đánh dấu bị ảnh hưởng bởi các đặc điểm nhất định của các nhóm lân cận. Tôi đã vẽ các lãnh thổ của mỗi nhóm từ 95% isopleths mật độ được tạo bằng a-LoCoH. Các dấu hiệu của mỗi cá nhân từ một nhóm được vẽ như một lớp điểm riêng biệt. Hành vi đánh dấu dường như không phải là ngẫu nhiên và dường như chúng tập trung xung quanh các ranh giới với các nhóm lân cận. Những gì tôi muốn điều tra xem các cá nhân đánh dấu gần một số nhóm hơn là gần các nhóm khác, ví dụ, các cá nhân đánh dấu ít gần các nhóm có liên quan chặt chẽ? Có thể chỉ ra rằng các điểm đang phân cụm gần một số tính năng nhưng không gần các điểm khác?

Bất kỳ trợ giúp có thể được cung cấp sẽ được đánh giá rất cao,

Dave Humphries

##### cập nhật

Để trình diễn, bên dưới là hình ảnh của bốn lãnh thổ (A, B, C và D) và vị trí đánh dấu của hai cá nhân từ nhóm A. Nhóm A và B có liên quan chặt chẽ với nhau. Nhóm C và D không liên quan đến nhóm A.

nhập mô tả hình ảnh ở đây


1
Bạn có thể cung cấp dữ liệu mẫu?
om_henners

Xin lỗi, tôi chưa quen với trao đổi ngăn xếp - và GIS cho vấn đề đó, định dạng chuẩn để cung cấp dữ liệu mẫu là gì? Tài liệu ArcMap?
Dave Humphries

1
Dữ liệu mẫu phải được xuất bản theo định dạng GIS mở bởi nhiều hệ thống GIS.
markusN

Một số tệp có liên quan là shapefiles và theo tôi hiểu thì hiện tại không có cách nào để chia sẻ các loại tệp này trên SE. Tôi rất vui khi cung cấp các ví dụ qua e-mail tại: david.humphries@mq.edu.au
Dave Humphries

Một câu hỏi khác trong khi tôi đang suy nghĩ về điều này (nghỉ lễ) - các ranh giới a-LoCoH được tạo ra từ cùng một bộ dữ liệu đánh dấu hay một bộ dữ liệu khác nhau hoàn toàn? Ngoài ra, loại phần mềm nào bạn đang sử dụng (và bạn có quyền truy cập) không?
om_henners

Câu trả lời:


1

Tôi thực sự khuyên bạn nên xem R , đặc biệt là gói spatstat từ CSRIO. Có một hướng dẫn / hướng dẫn tuyệt vời của Giáo sư Adrian Baddeley có sẵn sẽ đưa bạn qua một loạt các phương pháp khác nhau để phân tích mô hình điểm. Particulraly Tôi sẽ xem Phần VII: Các mẫu điểm được đánh dấu (cụ thể là hàm tương quan Mark ở trang 202). Lưu ý ở đây đề cập đến dữ liệu được phân loại theo một thuộc tính thay vì có mối quan hệ số.

Ngoài ra còn có một chương về đọc dữ liệu trong (sử dụng rgdal , sp , v.v.) ở đầu tài liệu. Nếu bạn đang sử dụng ArcGIS, tôi sẽ xem Môi trường mô hình hóa không gian địa lý như một cách để liên kết giữa dữ liệu trong R và ArcGIS, nếu không, QGIS có ManageR cũng sẽ làm như vậy.

Cuối cùng @whuber (trong số nhiều người khác) ở đây trên GIS SE có một lượng kinh nghiệm khổng lồ trong R, vì vậy hãy đặt câu hỏi khi bạn tìm thấy chúng hoặc thử và bắt anh ấy trong cuộc trò chuyện.


Cảm ơn rất nhiều cho đề xuất của bạn. Tôi sẽ thử gói spatstat và xem tôi đi như thế nào.
Dave Humphries
Khi sử dụng trang web của chúng tôi, bạn xác nhận rằng bạn đã đọc và hiểu Chính sách cookieChính sách bảo mật của chúng tôi.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.