Lấy giá trị pixel của raster GDAL dưới điểm OGR mà không có NumPy?

Tôi đang làm việc trên một mô hình tính toán về sự phong phú của các loài thụ phấn hoang dã trên toàn cảnh. Bản thân mô hình đã hoàn tất và tôi hiện đang vật lộn với một bước xử lý hậu kỳ.

Tôi có raster cung cấp trình thụ phấn GDAL của tôi trông giống như thế này (màu nhạt hơn có nghĩa là lượt truy cập của người thụ phấn cao hơn đến một pixel):

Và tôi có một shapefile các điểm đại diện cho các vị trí mẫu trên phong cảnh:

Tôi đang cố gắng chạy một số phân tích về các pixel theo các điểm này, nhưng để làm như vậy, tôi cần có thể trích xuất giá trị của một pixel dưới một điểm.

Có thể trích xuất giá trị của pixel dưới một điểm chỉ bằng OGR và GDAL thông qua Python không? Tôi muốn tránh đọc toàn bộ raster vào bộ nhớ ReadAsArray(), vì các raster đầu ra của tôi rất, rất lớn (quá lớn để vừa với bộ nhớ).

Tôi nhận thấy bài đăng này , tương tự, nhưng yêu cầu một cuộc gọi dòng lệnh.

Bạn có thể sử dụng phương thức gdal.Dataset hoặc gdal.Band ReadRaster. Xem hướng dẫn API GDAL và OGR và ví dụ bên dưới. ReadRaster không sử dụng / yêu cầu numpy, giá trị trả về là dữ liệu nhị phân thô và cần được giải nén bằng mô-đun cấu trúc python tiêu chuẩn .

Một ví dụ:

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    structval=rb.ReadRaster(px,py,1,1,buf_type=gdal.GDT_UInt16) #Assumes 16 bit int aka 'short'
    intval = struct.unpack('h' , structval) #use the 'short' format code (2 bytes) not int (4 bytes)

    print intval[0] #intval is a tuple, length=1 as we only asked for 1 pixel value

Ngoài ra, vì lý do bạn đưa ra không sử dụng numpylà để tránh đọc toàn bộ mảng khi sử dụng ReadAsArray(), dưới đây là một ví dụ sử dụng numpyvà không đọc toàn bộ raster trong.

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    intval=rb.ReadAsArray(px,py,1,1)
    print intval[0] #intval is a numpy array, length=1 as we only asked for 1 pixel value