Sửa một cảnh báo nhiều cột không rõ

Tôi có một cảnh báo nhiều lần về "cột không xác định" cho tất cả các loại lệnh (ví dụ: str (x) để cài đặt các bản cập nhật trên các gói) và không chắc chắn làm thế nào để gỡ lỗi này hoặc sửa nó.

"Cột không xác định" cảnh báo rõ ràng có liên quan đến một biến trong tbl_df mà tôi đã đổi tên, nhưng cảnh báo xuất hiện trong tất cả các loại lệnh dường như không liên quan đến tbl_df (ví dụ: cài đặt các bản cập nhật trên gói, str (x) trong đó x là chỉ đơn giản là một vectơ ký tự).

Đây là một vấn đề với công cụ Chẩn đoán trong RStudio (công cụ hiển thị các cảnh báo và các lỗi có thể xảy ra trong mã của bạn). Nó đã được sửa một phần tại cam kết này trong RStudio v1.1.103 trở lên bởi @ kevin-ushey . Khắc phục là một phần, bởi vì các cảnh báo vẫn xuất hiện (mặc dù với tần suất ít hơn). Vấn đề này đã được báo cáo với một ví dụ có thể tái tạo tại https://github.com/rstudio/rstudio/issues/7372 và đã được khắc phục theo yêu cầu kéo RStudio v1.4 (sẽ được phát hành)

Có một số cách giải quyết có sẵn, chọn giải pháp bạn thích:

• Vô hiệu hóa chẩn đoán mã cho tất cả các tệp trong Tùy chọn / Mã / Chẩn đoán

• Vô hiệu hóa tất cả các chẩn đoán cho một tệp cụ thể:

  Thêm vào đầu tập tin đã mở:

   # !diagnostics off

  Sau đó lưu các tập tin và các cảnh báo sẽ ngừng xuất hiện.

• Vô hiệu hóa chẩn đoán cho các biến gây ra cảnh báo

  Thêm vào đầu tập tin đã mở:

   # !diagnostics suppress=<comma-separated list of variables>

  Sau đó lưu các tập tin và các cảnh báo sẽ ngừng xuất hiện.

Các cảnh báo xuất hiện do công cụ chẩn đoán trong RStudio phân tích mã nguồn để phát hiện lỗi và khi thực hiện kiểm tra chẩn đoán, nó truy cập các cột trong phần mềm không được khởi tạo, đưa ra Cảnh báo mà chúng ta thấy. Các cảnh báo không xuất hiện do bạn chạy những thứ không liên quan, chúng xuất hiện khi chẩn đoán RStudio được thực thi (khi tệp được lưu, sau đó được sửa đổi, khi bạn chạy thứ gì đó ...).

Tôi đã gặp phải vấn đề tương tự, và mặc dù tôi không biết tại sao nó lại xảy ra, tôi đã có thể xác định được khi nó xảy ra, và do đó ngăn nó xảy ra.

Vấn đề dường như là với việc thêm vào một cột mới, xuất phát từ việc lập chỉ mục, trong khung dữ liệu R cơ sở so với khung dữ liệu có thể sử dụng được. Lấy ví dụ này, nơi bạn thêm một cột mới ( age) vào khung dữ liệu R cơ sở:

base_df <- data.frame(id = c(1:3), name = c("mary", "jill","steve"))

base_df$age[base_df$name == "mary"] <- 47

Điều đó làm việc mà không trả lại một cảnh báo. Nhưng khi điều tương tự được thực hiện với một cú đánh, nó sẽ đưa ra một cảnh báo (và do đó, tôi nghĩ rằng gây ra vấn đề kỳ lạ, dường như không được cung cấp, nhiều cảnh báo):

library(tibble)

tibble_df <- tibble(id = c(1:3), name = c("mary", "jill","steve"))

tibble_df$age[tibble_df$name == "mary"] <- 47

Warning message:
Unknown column 'age' 

Chắc chắn có nhiều cách tốt hơn để tránh điều này, nhưng tôi đã thấy rằng trước tiên việc tạo ra một vectơ NAs thực hiện công việc:

tibble_df$age <- NA

tibble_df$age[tibble_df$name == "mary"] <- 47

Tôi đã phải đối mặt với vấn đề này khi sử dụng gói "dplyr".
Đối với những người gặp phải vấn đề này sau khi sử dụng chức năng "group_by" trong thư viện "dplyr":

Tôi đã thấy rằng việc bỏ các biến giải quyết vấn đề cảnh báo cột không xác định. Đôi khi tôi đã phải lặp đi lặp lại nhiều lần cho đến khi vấn đề được giải quyết.

Chuyển đổi lớp thành data.framegiải quyết vấn đề cho tôi:

library(dplyr)
df <- data.frame(id = c(1,1:3), name = c("mary", "jo", "jill","steve"))
dfTbl <- df %>%
  group_by(id) %>%
  summarize (n = n())
class(dfTbl) # [1] "tbl_df"     "tbl"        "data.frame"
dfTbl = as.data.frame(dfTbl)
class(dfTbl) # [1] "data.frame"

Mượn đoạn script một phần từ @adts

Tôi đã có vấn đề này khi xử lý các chức năng nhanh nhẹn và lapply với nhau. Các tibble dường như lưu mọi thứ như một danh sách bên trong khung dữ liệu.

Tôi đã giải quyết nó bằng cách sử dụng unlist trước khi thêm kết quả của hàm lapply vào tibble.

Tôi cũng gặp phải vấn đề này ngoại trừ thông qua một thao tác được tạo bằng cách sử dụng khối dyplyr. Đây là một sửa đổi nhỏ về mã của sabre để cho thấy tôi đã gặp phải lỗi tương tự như thế nào.

library(dplyr)

df <- data.frame(id = c(1,1:3), name = c("mary", "jo", "jill","steve"))

t <- df %>%
  group_by(id) %>%
  summarize (n = n())

t
str(t)


t$newvar[t$id==1] <- 0

Giả sử tôi muốn chọn (các) cột sau

best.columns = 'id'

Đối với tôi sau đây đã đưa ra cảnh báo:

df%>% select_(one_of(best.columns))

Mặc dù điều này hoạt động như mong đợi, mặc dù, theo như tôi biết dplyr, điều này nên giống hệt nhau.

df%>% select_(.dots = best.columns)

Tôi nhận được các cảnh báo này khi tôi đổi tên một cột bằng dplyr::renamecách sử dụng readrgói đó.

Tên cũ của cột không được đổi tên trong specthuộc tính. Vì vậy, loại bỏ các specthuộc tính làm cho các cảnh báo biến mất. Ngoài ra, loại bỏ lớp "spec_tbl_df" có vẻ là một ý tưởng tốt.

attr(dat, "spec") <- NULL
class(dat) <- setdiff(class(dat), "spec_tbl_df")