Bất kỳ cách nhanh hơn để kiểm tra nếu danh sách trong một danh sách là tương đương?


9

Ở đây tôi có các số nguyên 1:7cho bốn phân vùng khác nhau, ví dụ: {1}, {2,3,4}, {5,6} và {7} và các phân vùng đó được ghi trong một danh sách, nghĩa là , list(1,c(2,3,4),c(5,6),7). Tôi coi các phân vùng là các tập hợp, sao cho các phần tử hoán vị khác nhau trong một phân vùng phải được công nhận là cùng một phân vùng. Ví dụ, list(1,c(2,3,4),c(5,6),7)list(7,1,c(2,3,4),c(6,5))là tương đương.

Lưu ý rằng, không có sự lặp lại cho các thành phần trong danh sách, ví dụ, không list(c(1,2),c(2,1),c(1,2)), vì vấn đề này đang thảo luận về các phân vùng độc quyền trên toàn bộ.

Tôi liệt kê một số hoán vị khác nhau vào danh sách lstnhư dưới đây

lst <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6),7),
            list(c(2,3,4),1,7,c(5,6)),
            list(1,c(2,3,4),7,c(6,5)),
            list(7,1,c(3,2,4),c(5,6)))

và những gì tôi muốn làm là xác minh tất cả các hoán vị là tương đương. Nếu có, sau đó chúng tôi nhận được kết quả TRUE.

Những gì tôi đã làm cho đến nay là để sắp xếp các yếu tố trong mỗi phân vùng, và được sử dụng setdiff()với interset()union()để đánh giá nó (xem mã của tôi dưới đây)

s <- Map(function(v) Map(sort,v),lst)
equivalent <- length(setdiff(Reduce(union,s),Reduce(intersect,s),))==0

Tuy nhiên, tôi đoán phương pháp này sẽ chậm bất cứ khi nào kích thước phân vùng tăng lên. Có cách tiếp cận nào nhanh hơn để làm cho nó? Đánh giá cao trước!

  • một số trường hợp thử nghiệm (dữ liệu kích thước nhỏ)
# should return `TRUE`
lst1 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)),
            list(c(2,3,4),1,c(5,6)),
            list(1,c(2,3,4),c(6,5)))

# should return `TRUE`
lst2 <- list(list(1:2, 3:4), list(3:4, 1:2))

# should return `FALSE`
lst3 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)), list(c(2,3,4),1,c(5,6)), list(1,c(2,3,5),c(6,4)))

1
Tôi đoán bạn có thể tránh được nhiều Mapcuộc gọi
từ

1
Tôi khuyên bạn nên thêm một vài trường hợp kiểm tra vào câu hỏi của bạn, một trường hợp có phân vùng có kích thước bằng nhau lst_equal = list(list(1:2, 3:4), list(3:4, 1:2))và cũng là trường hợp có kết quả FALSE, có thểlst_false <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)), list(c(2,3,4),1,c(5,6)), list(1,c(2,3,5),c(6,4)))
Gregor Thomas

3
Tôi thực sự khuyên bạn nên có nhiều ví dụ nhỏ - bao gồm một số nơi có kết quả mong đợi FALSE. Theo cách đó, khi một câu trả lời hoạt động trên một số, nhưng không phải tất cả, các trường hợp thử nghiệm, thật dễ dàng để chẩn đoán tại sao. Khi chỉ có một ví dụ duy nhất, bạn sẽ mất sắc thái trong kết quả kiểm tra. Thật tốt khi thêm các ví dụ mới thay vì thay đổi các ví dụ hiện có dưới những người đã làm việc với chúng.
Gregor Thomas

1
Tôi muốn thêm một nhận xét rằng mô tả của bạn khiến tôi nghĩ rằng bạn mong đợi kết quả là ĐÚNG, bạn chỉ đang xác minh nó. Nếu đây không phải là trường hợp (ví dụ, nếu bạn nghĩ rằng bạn sẽ nhận được số lượng FALSE đáng kể) và đặc biệt là nếu độ dài của lstnó có khả năng dài, bạn có thể đạt được hiệu quả với các phương pháp khác. Ví dụ: kiểm tra đầu tiên length(unique(lengths(lst))) == 1sẽ nhanh chóng quay trở lại FALSEnếu bất kỳ danh sách bên trong nào có số phần tử sai ....
Gregor Thomas

1
Nếu vượt qua điều đó, bạn có thể có thể muốn đi một mục tại một thời điểm thông qua lst, so sánh lst[[i]]với lst[[1]], và cách mà bạn có thể dừng lại ngay sau khi bạn tìm thấy một không phù hợp, chứ không phải làm tất cả những so sánh. Nếu lstdài và FALSEs là phổ biến, điều này có thể đạt được hiệu quả lớn, nhưng có lẽ không có giá trị khác.
Gregor Thomas

Câu trả lời:


6

Một bài viết về Rvà bất kỳ biến thể của nhanh không hoàn thành mà không có giải pháp có tính năng .

Để tối đa hóa hiệu quả, việc chọn cấu trúc dữ liệu chính xác sẽ là vô cùng quan trọng. Cấu trúc dữ liệu của chúng tôi cần lưu trữ các giá trị duy nhất và cũng có khả năng chèn / truy cập nhanh. Đây chính xác là những gì std :: unordered_set thể hiện. Chúng ta chỉ cần xác định làm thế nào chúng ta có thể xác định duy nhất mỗi vectorthứ không có thứ tự integers.

Nhập lý cơ bản của số học

FTA tuyên bố rằng mọi số có thể được biểu diễn duy nhất (theo thứ tự các yếu tố) bằng tích của các số nguyên tố.

Dưới đây là một ví dụ minh họa cách chúng ta có thể sử dụng FTA để giải mã nhanh nếu hai vectơ tương đương với thứ tự (NB Pbên dưới là danh sách các số nguyên tố ...(2, 3, 5, 7, 11, etc.) :

                   Maps to                    Maps to              product
vec1 = (1, 2, 7)    -->>    P[1], P[2], P[7]   --->>   2,  3, 17     -->>   102
vec2 = (7, 3, 1)    -->>    P[7], P[3], P[1]   --->>  17,  5,  2     -->>   170
vec3 = (2, 7, 1)    -->>    P[2], P[7], P[1]   --->>   3, 17,  2     -->>   102

Từ đó, chúng ta thấy rằng vec1vec3ánh xạ chính xác đến cùng một số, trong khi vec2được ánh xạ tới một giá trị khác.

Vì các vectơ thực tế của chúng tôi có thể chứa tới một trăm số nguyên nhỏ hơn 1000, áp dụng FTA sẽ mang lại số lượng cực lớn. Chúng ta có thể khắc phục điều này bằng cách tận dụng quy tắc sản phẩm của logarit:

log b (xy) = log b (x) + log b (y)

Với điều này theo ý của chúng tôi, chúng tôi sẽ có thể giải quyết ví dụ số lượng lớn hơn nhiều (Điều này bắt đầu xấu đi trên các ví dụ cực kỳ lớn).

Đầu tiên, chúng ta cần một trình tạo số nguyên tố đơn giản (NB Chúng tôi thực sự đang tạo nhật ký của từng số nguyên tố).

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

void getNPrimes(std::vector<double> &logPrimes) {

    const int n = logPrimes.size();
    const int limit = static_cast<int>(2.0 * static_cast<double>(n) * std::log(n));
    std::vector<bool> sieve(limit + 1, true);

    int lastP = 3;
    const int fsqr = std::sqrt(static_cast<double>(limit));

    while (lastP <= fsqr) {
        for (int j = lastP * lastP; j <= limit; j += 2 * lastP)
            sieve[j] = false;

        int ind = 2;

        for (int k = lastP + 2; !sieve[k]; k += 2)
            ind += 2;

        lastP += ind;
    }

    logPrimes[0] = std::log(2.0);

    for (int i = 3, j = 1; i <= limit && j < n; i += 2)
        if (sieve[i])
            logPrimes[j++] = std::log(static_cast<double>(i));
}

Và đây là cách thực hiện chính:

// [[Rcpp::export]]
bool f_Rcpp_Hash(List x) {

    List tempLst = x[0];
    const int n = tempLst.length();
    int myMax = 0;

    // Find the max so we know how many primes to generate
    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        const int tempMax = *std::max_element(v.cbegin(), v.cend());

        if (tempMax > myMax)
            myMax = tempMax;
    }

    std::vector<double> logPrimes(myMax + 1, 0.0);
    getNPrimes(logPrimes);
    double sumMax = 0.0;

    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        double mySum = 0.0;

        for (auto j: v)
            mySum += logPrimes[j];

        if (mySum > sumMax)
            sumMax = mySum;
    }

    // Since all of the sums will be double values and we want to
    // ensure that they are compared with scrutiny, we multiply
    // each sum by a very large integer to bring the decimals to
    // the right of the zero and then convert them to an integer.
    // E.g. Using the example above v1 = (1, 2, 7) & v2 = (7, 3, 1)
    //              
    //    sum of log of primes for v1 = log(2) + log(3) + log(17)
    //                               ~= 4.62497281328427
    //
    //    sum of log of primes for v2 = log(17) + log(5) + log(2)
    //                               ~= 5.13579843705026
    //    
    //    multiplier = floor(.Machine$integer.max / 5.13579843705026)
    //    [1] 418140173
    //    
    // Now, we multiply each sum and convert to an integer
    //    
    //    as.integer(4.62497281328427 * 418140173)
    //    [1] 1933886932    <<--   This is the key for v1
    //
    //    as.integer(5.13579843705026 * 418140173)
    //    [1] 2147483646    <<--   This is the key for v2

    const uint64_t multiplier = std::numeric_limits<int>::max() / sumMax;
    std::unordered_set<uint64_t> canon;
    canon.reserve(n);

    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        double mySum = 0.0;

        for (auto j: v)
            mySum += logPrimes[j];

        canon.insert(static_cast<uint64_t>(multiplier * mySum));
    }

    const auto myEnd = canon.end();

    for (auto it = x.begin() + 1; it != x.end(); ++it) {
        List tempLst = *it;

        if (tempLst.length() != n)
            return false;

        for (int j = 0; j < n; ++j) {
            IntegerVector v = tempLst[j];
            double mySum = 0.0;

            for (auto k: v)
                mySum += logPrimes[k];

            const uint64_t key = static_cast<uint64_t>(multiplier * mySum);

            if (canon.find(key) == myEnd)
                return false;
        }
    }

    return true;
}

Dưới đây là kết quả khi áp dụng để lst1, lst2, lst3, & lst (the large one)đưa ra bởi @GKi.

f_Rcpp_Hash(lst)
[1] TRUE

f_Rcpp_Hash(lst1)
[1] TRUE

f_Rcpp_Hash(lst2)
[1] FALSE

f_Rcpp_Hash(lst3)
[1] FALSE

Và đây là một số điểm chuẩn với unitstham số được đặt thành relative.

microbenchmark(check = 'equal', times = 10
               , unit = "relative"
               , f_ThomsIsCoding(lst3)
               , f_chinsoon12(lst3)
               , f_GKi_6a(lst3)
               , f_GKi_6b(lst3)
               , f_Rcpp_Hash(lst3))
Unit: relative
                 expr       min        lq      mean    median        uq       max neval
f_ThomsIsCoding(lst3) 84.882393 63.541468 55.741646 57.894564 56.732118 33.142979    10
   f_chinsoon12(lst3) 31.984571 24.320220 22.148787 22.393368 23.599284 15.211029    10
       f_GKi_6a(lst3)  7.207269  5.978577  5.431342  5.761809  5.852944  3.439283    10
       f_GKi_6b(lst3)  7.399280  5.751190  6.350720  5.484894  5.893290  8.035091    10
    f_Rcpp_Hash(lst3)  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000    10


microbenchmark(check = 'equal', times = 10
               , unit = "relative"
               , f_ThomsIsCoding(lst)
               , f_chinsoon12(lst)
               , f_GKi_6a(lst)
               , f_GKi_6b(lst)
               , f_Rcpp_Hash(lst))
Unit: relative
                expr        min         lq       mean     median        uq       max neval
f_ThomsIsCoding(lst) 199.776328 202.318938 142.909407 209.422530 91.753335 85.090838    10
   f_chinsoon12(lst)   9.542780   8.983248   6.755171   9.766027  4.903246  3.834358    10
       f_GKi_6a(lst)   3.169508   3.158366   2.555443   3.731292  1.902140  1.649982    10
       f_GKi_6b(lst)   2.992992   2.943981   2.019393   3.046393  1.315166  1.069585    10
    f_Rcpp_Hash(lst)   1.000000   1.000000   1.000000   1.000000  1.000000  1.000000    10

Nhanh hơn khoảng 3 lần so với giải pháp nhanh nhất trên ví dụ lớn hơn.

Điều đó có nghĩa là gì?

Đối với tôi, kết quả này nói lên rất nhiều về vẻ đẹp và hiệu quả base Rnhư được hiển thị bởi @GKi, @ chin gió12, @Gregor, @ThomasIsCoding, v.v. Chúng tôi đã viết khoảng 100 dòng rất cụ thể C++để tăng tốc độ vừa phải. Để công bằng, các base Rgiải pháp cuối cùng gọi phần lớn mã được biên dịch và cuối cùng sử dụng các bảng băm như chúng ta đã làm ở trên.


1
@ThomasIsCoding, tôi rất vinh dự khi bạn chọn câu trả lời của tôi, nhưng tôi thành thật tin rằng các câu trả lời khác tốt hơn.
Joseph Wood

1
Cảm ơn bạn rất nhiều vì sự đóng góp của bạn! Công việc của bạn thật xuất sắc!
ThomasIsCoding

5

Sau khi sắp xếp bạn có thể sử dụng duplicatedall.

s <- lapply(lst, function(x) lapply(x, sort)) #Sort vectors
s <- lapply(s, function(x) x[order(vapply(x, "[", 1, 1))]) #Sort lists
all(duplicated(s)[-1]) #Test if there are all identical
#length(unique(s)) == 1 #Alternative way to test if all are identical

Thay thế: Sắp xếp trong một vòng lặp

s <- lapply(lst, function(x) {
  tt <- lapply(x, sort)
  tt[order(vapply(tt, "[", 1, 1))]
})
all(duplicated(s)[-1])

Thay thế: Sắp xếp trong vòng lặp và cho phép thoát sớm

s <- lapply(lst[[1]], sort)
s <- s[order(vapply(s, "[", 1, 1))]
tt  <- TRUE
for(i in seq(lst)[-1]) {
  x <- lapply(lst[[i]], sort)
  x <- x[order(vapply(x, "[", 1, 1))]
  if(!identical(s, x)) {
    tt  <- FALSE
    break;
  }
}
tt

hoặc sử dụng setequal

s <- lapply(lst[[1]], sort)
tt  <- TRUE
for(i in seq(lst)[-1]) {
  x <- lapply(lst[[i]], sort)
  if(!setequal(s, x)) {
    tt  <- FALSE
    break;
  }
}
tt

hoặc cải thiện một chút ý tưởng từ @ chin gió12 để trao đổi danh sách với một vectơ!

s <- lst[[1]][order(vapply(lst[[1]], min, 1))]
s <- rep(seq_along(s), lengths(s))[order(unlist(s))]
tt <- TRUE
for(i in seq(lst)[-1]) {
  x <- lst[[i]][order(vapply(lst[[i]], min, 1))]
  x <- rep(seq_along(x), lengths(x))[order(unlist(x))]
  if(!identical(s, x)) {tt <- FALSE; break;}
}
tt

hoặc tránh thứ hai order

s <- lst[[1]][order(vapply(lst[[1]], min, 1))]
s <- rep(seq_along(s), lengths(s))[order(unlist(s))]
y <- s
tt <- TRUE
for(i in seq(lst)[-1]) {
  x <- lst[[i]][order(vapply(lst[[i]], min, 1))]
  y <- y[0]
  y[unlist(x)] <- rep(seq_along(x), lengths(x))
  if(!identical(s, y)) {tt <- FALSE; break;}
}
tt

hoặc trao đổi ordervới match(hoặc fmatch)

x <- lst[[1]]
s <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
s <- match(s, unique(s))
tt <- TRUE
for(i in seq(lst)[-1]) {
  x <- lst[[i]]
  y <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
  y <- match(y, unique(y))
  if(!identical(s, y)) {tt <- FALSE; break;}
}
tt

Hoặc không có lối ra sớm.

s <- lapply(lst, function(x) {
  y <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
  match(y, unique(y))
})
all(duplicated(s)[-1])

hoặc viết bằng C ++

sourceCpp(code = "#include <Rcpp.h>
#include <vector>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
// [[Rcpp::export]]
bool f_GKi_6_Rcpp(const List &x) {
  const List &x0 = x[0];
  const unsigned int n = x0.length();
  unsigned int nn = 0;
  for (List const &i : x0) {nn += i.length();}
  std::vector<int> s(nn);
  for (unsigned int i=0; i<n; ++i) {
    const IntegerVector &v = x0[i];
    for (int const &j : v) {
      if(j > nn) return false;
      s[j-1] = i;
    }
  }
  {
    std::vector<int> lup(n, -1);
    int j = 0;
    for(int &i : s) {
      if(lup[i] < 0) {lup[i] = j++;}
      i = lup[i];
    }
  }
  for (List const &i : x) {
    if(i.length() != n) return false;
    std::vector<int> sx(nn);
    for(unsigned int j=0; j<n; ++j) {
      const IntegerVector &v = i[j];
      for (int const &k : v) {
        if(k > nn) return false;
        sx[k-1] = j;
      }
    }
    {
      std::vector<int> lup(n, -1);
      int j = 0;
      for(int &i : sx) {
        int &lupp = lup[i];
        if(lupp == -1) {lupp = j; i = j++;
        } else {i = lupp;}
      }
    }
    if(s!=sx) return false;
  }
  return true;
}
")

Cảm ơn @Gregor đã gợi ý để cải thiện câu trả lời!


Tôi không nghĩ rằng nó sẽ hoạt động khi có các phân vùng có kích thước bằng nhau ,,, nhưng nên nhanh hơn của tôi khi có các phân vùng có kích thước không bằng nhau. Ví dụ: lst <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6),7), list(c(2,3,4),1,7,c(5,6)), list(1,c(2,3,4),7,c(6,5)), list(7,1,c(3,2,4),c(5,6)))sẽ được đánh giá làFALSE
ThomasIsCoding

1
@Gregor Cảm ơn các mẹo để sắp xếp theo min!
GKi

Trông thật tuyệt! Tôi sẽ đợi thêm một thời gian nữa để xem có giải pháp nào nhanh hơn không.
ThomasIsCoding

các kích thước thực tế của bộ dữ liệu của bạn để bạn tìm kiếm một giải pháp nhanh hơn là gì?
chin gió12

Tôi đã thêm điểm chuẩn hiệu suất để xem hiệu quả (xem bài đăng mới được chỉnh sửa của tôi). Giải pháp của bạn nhanh hơn của tôi, đặc biệt là bước hai bước. Tôi muốn đợi cho đến khi bất kỳ giải pháp nào có cải tiến lớn hơn xuất hiện, nếu không thì giải pháp của bạn sẽ được chấp nhận là tốt nhất. Cám ơn bạn một lần nữa!
ThomasIsCoding

4

Hiệu suất:

library(microbenchmark)

microbenchmark(check = 'equal', times=10
  , f_ThomsIsCoding(lst1)
  , f_chinsoon12(lst1)
  , f_GKi_6a(lst1)
  , f_GKi_6b(lst1)
  , f_GKi_6_Rcpp(lst1)
  , f_Rcpp_Hash(lst1))
#Unit: microseconds
#                  expr        min         lq        mean     median         uq        max neval
# f_ThomsIsCoding(lst1) 161187.790 162453.520 167107.5739 167899.471 169441.028 174746.156    10
#    f_chinsoon12(lst1)  64380.792  64938.528  66983.9449  67357.924  68487.438  69201.032    10
#        f_GKi_6a(lst1)   8833.595   9201.744  10377.5844   9407.864  12145.926  14662.022    10
#        f_GKi_6b(lst1)   8815.592   8913.950   9877.4948   9112.924  10941.261  12553.845    10
#    f_GKi_6_Rcpp(lst1)    394.754    426.489    539.1494    439.644    451.375   1327.885    10
#     f_Rcpp_Hash(lst1)    327.665    374.409    499.4080    398.101    495.034   1198.674    10

microbenchmark(check = 'equal', times=10
  , f_ThomsIsCoding(lst2)
  , f_chinsoon12(lst2)
  , f_GKi_6a(lst2)
  , f_GKi_6b(lst2)
  , f_GKi_6_Rcpp(lst2)
  , f_Rcpp_Hash(lst2))
#Unit: microseconds
#                  expr       min        lq        mean      median         uq        max neval
# f_ThomsIsCoding(lst2) 93808.603 99663.651 103358.2039 104676.1600 107124.879 107485.696    10
#    f_chinsoon12(lst2)   131.320   147.192    192.5354    188.1935    205.053    337.062    10
#        f_GKi_6a(lst2)  8630.970  9554.279  10681.9510   9753.2670  11970.377  13489.243    10
#        f_GKi_6b(lst2)    39.736    47.916     61.3929     52.7755     63.026    110.808    10
#    f_GKi_6_Rcpp(lst2)    43.017    51.022     72.8736     76.3465     86.527    116.060    10
#     f_Rcpp_Hash(lst2)     3.667     4.237     20.5887     16.3000     18.031     96.728    10

microbenchmark(check = 'equal', times=10
  , f_ThomsIsCoding(lst3)
  , f_chinsoon12(lst3)
  , f_GKi_6a(lst3)
  , f_GKi_6b(lst3)
  , f_GKi_6_Rcpp(lst3)
  , f_Rcpp_Hash(lst3))
#Unit: microseconds
#                  expr        min         lq        mean      median         uq        max neval
# f_ThomsIsCoding(lst3) 157660.501 166914.782 167067.2512 167204.9065 168055.941 177153.694    10
#    f_chinsoon12(lst3)    139.157    181.019    183.9257    188.0950    198.249    211.860    10
#        f_GKi_6a(lst3)   9484.496   9617.471  10709.3950  10056.1865  11812.037  12830.560    10
#        f_GKi_6b(lst3)     33.583     36.338     47.1577     42.6540     63.469     66.640    10
#    f_GKi_6_Rcpp(lst3)     60.010     60.455     89.4963     94.7220    104.271    121.431    10
#     f_Rcpp_Hash(lst3)      4.404      5.518      9.9811      6.5115     17.396     20.090    10

microbenchmark(check = 'equal', times=10
  , f_ThomsIsCoding(lst4)
  , f_chinsoon12(lst4)
  , f_GKi_6a(lst4)
  , f_GKi_6b(lst4)
  , f_GKi_6_Rcpp(lst4)
  , f_Rcpp_Hash(lst4))
#Unit: milliseconds
#                  expr         min          lq       mean      median          uq        max neval
# f_ThomsIsCoding(lst4) 1874.129146 1937.643431 2012.99077 2002.460746 2134.072981 2187.46886    10
#    f_chinsoon12(lst4)   69.949917   74.393779   80.25362   76.595763   87.116571  100.57917    10
#        f_GKi_6a(lst4)   23.259178   23.328548   27.62690   28.856612   30.675259   32.57509    10
#        f_GKi_6b(lst4)   22.200969   22.326122   24.20769   23.023687   23.619360   31.74266    10
#    f_GKi_6_Rcpp(lst4)    8.062451    8.228526   10.30559    8.363314   13.425531   13.80677    10
#     f_Rcpp_Hash(lst4)    6.551370    6.586025    7.22958    6.724232    6.809745   11.97631    10

Thư viện:

system.time(install.packages("Rcpp"))
#       User      System verstrichen 
#     27.576       1.147      29.396 

system.time(library(Rcpp))
#       User      System verstrichen 
#      0.070       0.000       0.071 

Chức năng:

system.time({f_ThomsIsCoding <- function(lst) {
  s <- Map(function(v) Map(sort,v),lst)
  length(setdiff(Reduce(union,s),Reduce(intersect,s)))==0
}})
#       User      System verstrichen 
#          0           0           0 

#like GKi's solution to stop early when diff is detected
system.time({f_chinsoon12  <- function(lst) {
    x <- lst[[1L]]
    y <- x[order(lengths(x), sapply(x, min))]
    a <- rep(seq_along(y), lengths(y))[order(unlist(y))]
    for(x in lst[-1L]) {
        y <- x[order(lengths(x), sapply(x, min))]
        a2 <- rep(seq_along(y), lengths(y))[order(unlist(y))]
        if(!identical(a, a2)) {
            return(FALSE)
        }
    }
    TRUE
}})
#       User      System verstrichen 
#          0           0           0 

system.time({f_GKi_6a <- function(lst) {
  all(duplicated(lapply(lst, function(x) {
    y <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
    match(y, unique(y))
  }))[-1])
}})
#      User      System verstrichen 
#          0           0           0 

system.time({f_GKi_6b <- function(lst) {
  x <- lst[[1]]
  s <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
  s <- match(s, unique(s))
  for(i in seq(lst)[-1]) {
    x <- lst[[i]]
    y <- "[<-"(integer(),unlist(x),rep(seq_along(x), lengths(x)))
    y <- match(y, unique(y))
    if(!identical(s, y)) return(FALSE)
  }
  TRUE
}})
#       User      System verstrichen 
#          0           0           0 

system.time({sourceCpp(code = "#include <Rcpp.h>
#include <vector>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
// [[Rcpp::export]]
bool f_GKi_6_Rcpp(const List &x) {
  const List &x0 = x[0];
  const unsigned int n = x0.length();
  unsigned int nn = 0;
  for (List const &i : x0) {nn += i.length();}
  std::vector<int> s(nn);
  for (unsigned int i=0; i<n; ++i) {
    const IntegerVector &v = x0[i];
    for (int const &j : v) {
      if(j > nn) return false;
      s[j-1] = i;
    }
  }
  {
    std::vector<int> lup(n, -1);
    int j = 0;
    for(int &i : s) {
      if(lup[i] < 0) {lup[i] = j++;}
      i = lup[i];
    }
  }
  for (List const &i : x) {
    if(i.length() != n) return false;
    std::vector<int> sx(nn);
    for(unsigned int j=0; j<n; ++j) {
      const IntegerVector &v = i[j];
      for (int const &k : v) {
        if(k > nn) return false;
        sx[k-1] = j;
      }
    }
    {
      std::vector<int> lup(n, -1);
      int j = 0;
      for(int &i : sx) {
        int &lupp = lup[i];
        if(lupp == -1) {lupp = j; i = j++;
        } else {i = lupp;}
      }
    }
    if(s!=sx) return false;
  }
  return true;
}
")})
#       User      System verstrichen 
#      3.265       0.217       3.481 

system.time({sourceCpp(code = "#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

void getNPrimes(std::vector<double> &logPrimes) {
    const int n = logPrimes.size();
    const int limit = static_cast<int>(2.0 * static_cast<double>(n) * std::log(n));
    std::vector<bool> sieve(limit + 1, true);
    int lastP = 3;
    const int fsqr = std::sqrt(static_cast<double>(limit));

    while (lastP <= fsqr) {
        for (int j = lastP * lastP; j <= limit; j += 2 * lastP)
            sieve[j] = false;
        int ind = 2;
        for (int k = lastP + 2; !sieve[k]; k += 2)
            ind += 2;
        lastP += ind;
    }
    logPrimes[0] = std::log(2.0);
    for (int i = 3, j = 1; i <= limit && j < n; i += 2)
        if (sieve[i])
            logPrimes[j++] = std::log(static_cast<double>(i));
}

// [[Rcpp::export]]
bool f_Rcpp_Hash(List x) {
    List tempLst = x[0];
    const int n = tempLst.length();
    int myMax = 0;
    // Find the max so we know how many primes to generate
    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        const int tempMax = *std::max_element(v.cbegin(), v.cend());
        if (tempMax > myMax)
            myMax = tempMax;
    }
    std::vector<double> logPrimes(myMax + 1, 0.0);
    getNPrimes(logPrimes);
    double sumMax = 0.0;
    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        double mySum = 0.0;
        for (auto j: v)
            mySum += logPrimes[j];
        if (mySum > sumMax)
            sumMax = mySum;
    }
    const uint64_t multiplier = std::numeric_limits<int>::max() / sumMax;
    std::unordered_set<uint64_t> canon;
    canon.reserve(n);
    for (int i = 0; i < n; ++i) {
        IntegerVector v = tempLst[i];
        double mySum = 0.0;
        for (auto j: v)
            mySum += logPrimes[j];
        canon.insert(static_cast<uint64_t>(multiplier * mySum));
    }
    const auto myEnd = canon.end();
    for (auto it = x.begin() + 1; it != x.end(); ++it) {
        List tempLst = *it;
        if (tempLst.length() != n)
            return false;
        for (int j = 0; j < n; ++j) {
            IntegerVector v = tempLst[j];
            double mySum = 0.0;
            for (auto k: v)
                mySum += logPrimes[k];
            const uint64_t key = static_cast<uint64_t>(multiplier * mySum);
            if (canon.find(key) == myEnd)
                return false;
        }
    }
    return true;
}
")})
#       User      System verstrichen 
#      3.507       0.155       3.662 

Dữ liệu:

lst1 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)) #TRUE
           , list(c(2,3,4),1,c(5,6))
           , list(1,c(2,3,4),c(6,5)))
lst2 <- list(list(c(2,3,4),c(1,5,6)) #FALSE
           , list(c(2,3,6),c(1,5,4))
           , list(c(2,3,4),c(1,5,6)))
lst3 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)) #FALSE
           , list(c(2,3,4),1,c(5,6))
           , list(1,c(2,3,5),c(6,4)))
set.seed(7)
N  <- 1e3
lst1 <- lst1[sample(seq(lst1), N, TRUE)]
lst2 <- lst2[sample(seq(lst2), N, TRUE)]
lst3 <- lst3[sample(seq(lst3), N, TRUE)]
N <- 1000
M <- 500
l <- unname(split(1:N,findInterval(1:N,sort(sample(1:N,N/10)),left.open = T)))
lst4 <- lapply(lapply(1:M, 
                     function(k) lapply(l, 
                                        function(v) v[sample(seq_along(v),length(v))])), function(x) x[sample(seq_along(x),length(x))])

Cảm ơn rât nhiều! Tôi chỉ nhận thấy rằng tôi đã mắc lỗi đánh máy trong mã của mình, điều đáng lẽ là length(setdiff(Reduce(union,s),Reduce(intersect,s)))==0 xin lỗi vì lỗi của tôi ....
ThomasIsCoding

@ThomasIsCoding Trả lời được cập nhật. Nhưng tôi đã làm nó như một Wiki, vì vậy mọi người đều được chào đón để cập nhật và bao gồm các giải pháp mới và để điều này không lặp lại ở mọi nơi.
GKi

Cảm ơn những nỗ lực của bạn! Tôi nghĩ bây giờ giải pháp của tôi cho kết quả giống như của bạn sau khi sửa, nhưng chậm hơn so với của bạn :)
ThomasIsCoding

Tuyệt vời! Bạn cải thiện đáng kể hiệu suất! Tôi chấp nhận giải pháp của bạn!
ThomasIsCoding

@ chin gió12 cảm ơn bạn rất nhiều vì đã nhắc nhở tôi! Bây giờ tôi đã thay đổi nó thành một cái khác của anh ấy để nhận thức
ThomasIsCoding

3

Hy vọng lần thứ 2 may mắn

f <- function(lst) {
    s <- lapply(lst, function(x) {
        y <- x[order(lengths(x), sapply(x, min))]
        rep(seq_along(y), lengths(y))[order(unlist(y))]
    })
    length(unique(s))==1L
}

trường hợp thử nghiệm:

# should return `TRUE`
lst1 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)),
    list(c(2,3,4),1,c(5,6)),
    list(1,c(2,3,4),c(6,5)))

# should return `TRUE`
lst2 <- list(list(1:2, 3:4), list(3:4, 1:2))

# should return `FALSE`
lst3 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)), list(c(2,3,4),1,c(5,6)), list(1,c(2,3,5),c(6,4)))

# should return `FALSE`
lst4 <- list(list(c(2,3,4),c(1,5,6)), list(c(2,3,6),c(1,5,4)), list(c(2,3,4),c(1,5,6)))

lst5 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)) #TRUE
    , list(c(2,3,4),1,c(5,6))
    , list(1,c(2,3,4),c(6,5)))
lst6 <- list(list(c(2,3,4),c(1,5,6)) #FALSE
    , list(c(2,3,6),c(1,5,4))
    , list(c(2,3,4),c(1,5,6)))
lst7 <- list(list(1,c(2,3,4),c(5,6)) #FALSE
    , list(c(2,3,4),1,c(5,6))
    , list(1,c(2,3,5),c(6,4)))

Séc:

f(lst1)
#[1] TRUE
f(lst2)
#[1] TRUE
f(lst3)
#[1] FALSE
f(lst4)
#[1] FALSE
f(lst5)
#[1] TRUE
f(lst6)
#[1] FALSE
f(lst7)
#[1] FALSE

mã thời gian:

library(microbenchmark)
set.seed(0L)
N <- 1000
M <- 100
l <- unname(split(1:N,findInterval(1:N,sort(sample(1:N,N/10)),left.open = T)))
lst <- lapply(lapply(1:M,
    function(k) lapply(l,
        function(v) v[sample(seq_along(v),length(v))])), function(x) x[sample(seq_along(x),length(x))])

f_ThomsIsCoding <- function(lst) {
    s <- Map(function(v) Map(sort,v),lst)
    length(setdiff(Reduce(union,s),Reduce(intersect,s)))==0
}

f_GKi_1 <- function(lst) {
    all(duplicated(lapply(lst, function(x) lapply(x, sort)[order(unlist(lapply(x, min)))]))[-1])
}

f_GKi_2 <- function(lst) {
    s <- lapply(lst, function(x) lapply(x, sort))
    all(duplicated(lapply(s, function(x) x[order(unlist(lapply(x, "[", 1)))]))[-1])
}


f <- function(lst) {
    s <- lapply(lst, function(x) {
        y <- x[order(lengths(x), sapply(x, min))]
        rep(seq_along(y), lengths(y))[order(unlist(y))]
    })
    length(unique(s))==1L
}

microbenchmark(times=3L,
    f_ThomsIsCoding(lst),
    f_GKi_1(lst),
    f_GKi_2(lst),
    f(lst)
)

thời gian:

Unit: milliseconds
                 expr       min        lq      mean    median        uq      max neval
 f_ThomsIsCoding(lst) 333.77313 334.61662 348.37474 335.46010 355.67555 375.8910     3
         f_GKi_1(lst) 324.12827 324.66580 326.33016 325.20332 327.43111 329.6589     3
         f_GKi_2(lst) 315.73533 316.05770 333.35910 316.38007 342.17099 367.9619     3
               f(lst)  12.42986  14.08256  15.74231  15.73526  17.39853  19.0618     3

Vâng, lần này nó hoạt động tốt
ThomasIsCoding
Khi sử dụng trang web của chúng tôi, bạn xác nhận rằng bạn đã đọc và hiểu Chính sách cookieChính sách bảo mật của chúng tôi.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.