CUDA không tương thích với phiên bản gcc của tôi

Tôi gặp sự cố khi biên dịch một số ví dụ đi kèm với CUDA SDK. Tôi đã cài đặt trình điều khiển dành cho nhà phát triển (phiên bản 270.41.19) và bộ công cụ CUDA, sau đó cuối cùng là SDK (cả phiên bản 4.0.17).

Ban đầu nó không biên dịch gì cả cho:

error -- unsupported GNU version! gcc 4.5 and up are not supported!

Tôi tìm thấy dòng chịu trách nhiệm trong 81: /usr/local/cuda/include/host_config.h và đã thay đổi nó thành:

//#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 4)
#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 6)

từ thời điểm đó, tôi chỉ có một số ví dụ để biên dịch, nó dừng lại với:

In file included from /usr/include/c++/4.6/x86_64-linux-gnu/bits/gthr.h:162:0,
             from /usr/include/c++/4.6/ext/atomicity.h:34,
             from /usr/include/c++/4.6/bits/ios_base.h:41,
             from /usr/include/c++/4.6/ios:43,
             from /usr/include/c++/4.6/ostream:40,
             from /usr/include/c++/4.6/iterator:64,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/iterator/iterator_categories.h:38,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_ptr.h:26,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_malloc_allocator.h:27,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_vector.h:26,
             from lineOfSight.cu:37:
/usr/include/c++/4.6/x86_64-linux-gnu/bits/gthr-default.h:251:1: error: pasting         "__gthrw_" and "/* Android's C library does not provide pthread_cancel, check for
`pthread_create' instead.  */" does not give a valid preprocessing token
make[1]: *** [obj/x86_64/release/lineOfSight.cu.o] Error 1

Như một số ví dụ biên dịch, tôi cho rằng đây không phải là vấn đề về trình điều khiển, mà là vấn đề liên quan đến một phiên bản gcc không được hỗ trợ. Hạ cấp không phải là một tùy chọn vì gcc4.6 có một hệ thống phụ thuộc vào thời điểm này ...

Như đã chỉ ra, nvcc phụ thuộc vào gcc 4.4. Có thể định cấu hình nvcc để sử dụng phiên bản gcc chính xác mà không cần chuyển bất kỳ tham số trình biên dịch nào bằng cách thêm liên kết mềm vào thư mục bin được tạo bằng cài đặt nvcc.

Thư mục nhị phân cuda mặc định (mặc định cài đặt) là / usr / local / cuda / bin, thêm một liên kết mềm vào đúng phiên bản gcc từ thư mục này là đủ:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc

gcc 4.5 và 4.6 không được hỗ trợ với CUDA - mã sẽ không biên dịch và phần còn lại của chuỗi công cụ, bao gồm cuda-gdb, sẽ không hoạt động bình thường. Bạn không thể sử dụng chúng và hạn chế là không thể thương lượng.

Giải pháp duy nhất của bạn là cài đặt phiên bản gcc 4.4 làm trình biên dịch thứ hai (hầu hết các bản phân phối sẽ cho phép điều đó). Có một tùy chọn cho nvcc --compiler-bindircó thể được sử dụng để trỏ đến một trình biên dịch thay thế. Tạo một thư mục cục bộ và sau đó tạo các liên kết tượng trưng đến các tệp thực thi phiên bản gcc được hỗ trợ. Chuyển thư mục cục bộ đó đến nvcc thông qua --compiler-bindirtùy chọn và bạn sẽ có thể biên dịch mã CUDA mà không ảnh hưởng đến phần còn lại của hệ thống.

CHỈNH SỬA :

Lưu ý rằng câu hỏi và câu trả lời này liên quan đến CUDA 4.

Kể từ khi nó được viết, NVIDIA đã tiếp tục mở rộng hỗ trợ cho các phiên bản gcc sau này trong bản phát hành chuỗi công cụ CUDA mới hơn

• Kể từ bản phát hành CUDA 4.1, gcc 4.5 hiện đã được hỗ trợ. gcc 4.6 và 4.7 không được hỗ trợ.
  
• Kể từ bản phát hành CUDA 5.0, gcc 4.6 hiện đã được hỗ trợ. gcc 4.7 không được hỗ trợ.
  
• Kể từ phiên bản CUDA 6.0, gcc 4.7 hiện đã được hỗ trợ.
• Kể từ bản phát hành CUDA 7.0, gcc 4.8 được hỗ trợ đầy đủ, với hỗ trợ 4.9 trên Ubuntu 14.04 và Fedora 21.
• Kể từ bản phát hành CUDA 7.5, gcc 4.8 được hỗ trợ đầy đủ, với hỗ trợ 4.9 trên Ubuntu 14.04 và Fedora 21.
• Kể từ bản phát hành CUDA 8, gcc 5.3 được hỗ trợ đầy đủ trên Ubuntu 16.06 và Fedora 23.
• Kể từ bản phát hành CUDA 9, gcc 6 được hỗ trợ đầy đủ trên Ubuntu 16.04, Ubuntu 17.04 và Fedora 25.
• Bản phát hành CUDA 9.2 bổ sung hỗ trợ cho gcc 7
• Bản phát hành CUDA 10.1 bổ sung hỗ trợ cho gcc 8

Hiện tại (kể từ CUDA 10.1) không có hỗ trợ gcc 9 trong CUDA.

Lưu ý rằng NVIDIA gần đây đã thêm một bảng rất hữu ích tại đây chứa trình biên dịch và ma trận hệ điều hành được hỗ trợ cho bản phát hành CUDA hiện tại.

1. Kiểm tra phiên bản GCC được hỗ trợ tối đa cho phiên bản CUDA của bạn:

    | CUDA version | max supported GCC version |
    |--------------|---------------------------|
    |      11      |             9             |
    |  10.1, 10.2  |             8             |
    |   9.2, 10.0  |             7             |
    |   9.0, 9.1   |             6             |
    |       8      |            5.3            |
    |       7      |            4.9            |
    |    5.5, 6    |            4.8            |
    |    4.2, 5    |            4.6            |
    |      4.1     |            4.5            |
    |      4.0     |            4.4            |

2. Đặt env var cho phiên bản GCC đó. Ví dụ, đối với CUDA 10.2:

    MAX_GCC_VERSION=8

3. Đảm bảo rằng bạn đã cài đặt phiên bản đó:

    sudo apt install gcc-$MAX_GCC_VERSION g++-$MAX_GCC_VERSION

4. Thêm các liên kết tượng trưng trong các thư mục CUDA:

    sudo ln -s /usr/bin/gcc-$MAX_GCC_VERSION /usr/local/cuda/bin/gcc 
    sudo ln -s /usr/bin/g++-$MAX_GCC_VERSION /usr/local/cuda/bin/g++

   (hoặc thay thế /usr/local/cudabằng đường dẫn cài đặt CUDA của bạn, nếu nó không có ở đó)

Xem ý chính GitHub này để biết thêm thông tin về bảng tương thích CUDA-GCC .

Giải pháp của Gearoid Murphy hoạt động tốt hơn đối với tôi vì trên bản phân phối của tôi (Ubuntu 11.10), gcc-4.4 và gcc-4.6 nằm trong cùng một thư mục, vì vậy --compiler-bindir không có ích gì. Cảnh báo duy nhất là tôi cũng phải cài đặt g ++ - 4.4 và liên kết biểu tượng với nó:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /usr/local/cuda/bin/g++

Đối với CUDA7.5 những dòng này hoạt động:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.9 /usr/local/cuda/bin/gcc 
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.9 /usr/local/cuda/bin/g++

Hãy xem cách sử dụng "các lựa chọn thay thế cập nhật" để khắc phục sự cố này:

... Nếu bạn cài đặt gcc 4.6, bạn cũng có thể sử dụng lệnh update-Alternatives để cho phép dễ dàng chuyển đổi giữa các phiên bản. Điều này có thể được định cấu hình với:

sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.6 60 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.6 
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.7 40 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.7 
sudo update-alternatives --config gcc

Nếu sử dụng cmakecho tôi, không có thủ thuật chỉnh sửa tệp và liên kết nào hoạt động, vì vậy tôi đã biên dịch bằng cách sử dụng cờ chỉ định phiên bản gcc / g ++.
cmake -DCMAKE_C_COMPILER=gcc-6 -DCMAKE_CXX_COMPILER=g++-6 ..

Làm việc như một sự quyến rũ.

Trên hầu hết các bản phân phối, bạn có thể cài đặt một phiên bản gcc và g ++ khác bên cạnh trình biên dịch mới nhất như gcc-4.7. Ngoài ra, hầu hết các hệ thống xây dựng đều biết về các biến CCvà CXXbiến môi trường, cho phép chỉ định cho bạn các trình biên dịch C và C ++ khác tương ứng. VẬY tôi đề nghị một cái gì đó như:

CC=gcc-4.4 CXX=g++-4.4 cmake path/to/your/CMakeLists.txt

Đối với Makefiles cũng nên có cách làm tương tự. Tôi không khuyên bạn nên đặt các liên kết tượng trưng tùy chỉnh trong / usr / local trừ khi bạn biết mình đang làm gì.

Điều này hoạt động với fedora 23. Kho lưu trữ compat gcc sẽ hơi khác dựa trên phiên bản fedora của bạn.

Nếu bạn cài đặt các kho lưu trữ sau:

sudo yum install compat-gcc-34-c++-3.4.6-37.fc23.x86_64 compat-gcc-34-3.4.6-37.fc23.x86_64 

Bây giờ hãy tạo các liên kết mềm như đã đề cập ở trên giả sử thư mục bin cuda của bạn nằm trong /usr/local/cuda/

sudo ln -s /usr/bin/gcc-34 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-34 /usr/local/cuda/bin/g++

Bây giờ bạn có thể biên dịch với nvccmà không gặp lỗi phiên bản gcc.

Giải pháp của Gearoid Murphy hoạt động như một sự quyến rũ. Đối với tôi, tôi có hai thư mục cho cuda -

/usr/local/cuda 
/usr/local/cuda-5.0

Các liên kết mềm chỉ được thêm vào thư mục được đề cập bên dưới -

/usr/local/cuda 

Ngoài ra, cả liên kết mềm g ++ và gcc đều được yêu cầu như được đề cập bởi SchighSchagh.

Một cách khác để định cấu hình nvcc để sử dụng một phiên bản cụ thể của gcc (ví dụ: gcc-4.4), là chỉnh sửa nvcc.profile và thay đổi PATH để bao gồm đường dẫn đến gcc mà bạn muốn sử dụng trước tiên.

Ví dụ (gcc-4.4.6 được cài đặt trong / opt):

PATH += /opt/gcc-4.4.6/lib/gcc/x86_64-unknown-linux-gnu/4.4.6:/opt/gcc-4.4.6/bin:$(TOP)/open64/bin:$(TOP)/share/cuda/nvvm:$(_HERE_):

Vị trí của nvcc.profile khác nhau, nhưng nó phải nằm trong cùng thư mục với chính tệp thực thi nvcc .

Đây là một chút hack, vì nvcc.profile không dành cho cấu hình người dùng theo hướng dẫn sử dụng nvcc, nhưng đó là giải pháp phù hợp nhất với tôi.

CUDA sau một số sửa đổi tiêu đề tương thích với gcc4.7 và có thể là phiên bản cao hơn: https://www.udacity.com/wiki/cs344/troubleshoot_gcc47

Đối với những người như tôi, những người bị nhầm lẫn khi sử dụng cmake, FindCUDA.cmaketập lệnh sẽ ghi đè một số nội dung từ nvcc.profile. Bạn có thể chỉ định nvcctrình biên dịch máy chủ lưu trữ bằng cách thiết lập CUDA_HOST_COMPILERtheo http://public.kitware.com/Bug/view.php?id=13674 .

Tôi đã phải cài đặt các phiên bản cũ hơn của gcc, g ++.

    sudo apt-get install gcc-4.4
    sudo apt-get install g++-4.4

Kiểm tra xem gcc-4.4 có trong / usr / bin / và tương tự đối với g ++ Sau đó, tôi có thể sử dụng giải pháp ở trên:

    sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /opt/cuda/bin/gcc
    sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /opt/cuda/bin/g++

Trong $CUDA_HOME/include/host_config.h, tìm các dòng như thế này (có thể hơi khác nhau giữa các phiên bản CUDA khác nhau):

//...
#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 9)

#error -- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!

#endif [> __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 9) <]
//...

Loại bỏ hoặc thay đổi chúng phù hợp với tình trạng của bạn.

Lưu ý rằng phương pháp này tiềm ẩn không an toàn và có thể phá vỡ cấu trúc của bạn. Ví dụ: gcc 5 sử dụng C ++ 11 làm mặc định, tuy nhiên, đây không phải là trường hợp của nvcc kể từ CUDA 7.5. Một cách giải quyết là thêm

--Xcompiler="--std=c++98" cho CUDA <= 6,5

hoặc là

--std=c++11 cho CUDA> = 7,0.

Nếu bạn gặp lỗi này, vui lòng đọc tệp nhật ký:

$ cat /var/log/cuda-installer.log 
[INFO]: Driver installation detected by command: apt list --installed | grep -e nvidia-driver-[0-9][0-9][0-9] -e nvidia-[0-9][0-9][0-9]
[INFO]: Cleaning up window
[INFO]: Complete
[INFO]: Checking compiler version...
[INFO]: gcc location: /usr/bin/gcc

[INFO]: gcc version: gcc version 9.2.1 20191008 (Ubuntu 9.2.1-9ubuntu2) 

[ERROR]: unsupported compiler version: 9.2.1. Use --override to override this check.

Chỉ cần làm theo gợi ý trong tệp nhật ký:

sudo sh cuda_<version>_linux.run --override

Công việc hoàn thành :)

Tôi vừa cài đặt CUDA 10.2 với gcc 9.2 trên Kubuntu 19.10 bằng cách sử dụng --overridetùy chọn.

Để biên dịch các ví dụ CUDA 8.0 trên Ubuntu 16.10, tôi đã làm:

sudo apt-get install gcc-5 g++-5
cd /path/to/NVIDIA_CUDA-8.0_Samples
# Find the path to the library (this should be in NVIDIA's Makefiles)
LIBLOC=`find /usr/lib -name "libnvcuvid.so.*" | head -n1 | perl -pe 's[/usr/lib/(nvidia-\d+)/.*][$1]'`
# Substitute that path into the makefiles for the hard-coded, incorrect one
find . -name "*.mk" | xargs perl -pi -e "s/nvidia-\d+/$LIBLOC/g"
# Make using the supported compiler
HOST_COMPILER=g++-5 make

Điều này có lợi thế là không sửa đổi toàn bộ hệ thống hoặc tạo các liên kết tượng trưng cho chỉ các tệp nhị phân (điều này có thể gây ra sự cố liên kết thư viện).

Điều này đã giải quyết vấn đề của tôi:

sudo rm /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo rm /usr/local/cuda/bin/g++
sudo apt install gcc-4.4 g++-4.4
sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /usr/local/cuda/bin/g++

Đối với CUDA 6.5 (và dường như là 7.0 và 7.5), tôi đã tạo một phiên bản của gói gcc 4.8.5 RPM (trong Fedora Core 30) cho phép cài đặt phiên bản gcc đó cùng với GCC hiện tại của hệ thống của bạn.

Bạn có thể tìm thấy tất cả các thông tin đó ở đây .

Trong trường hợp của tôi, tôi đã cài đặt CUDA từ phiên bản Ubuntu và cmake sẽ phát hiện ra cái đó thay vì phiên bản mới được cài đặt bằng Trình quản lý SDK NVidia.

Tôi đã chạy dpkg -l | grep cuda và có thể thấy cả hai phiên bản.

Những gì tôi phải làm là gỡ cài đặt CUDA cũ (trong trường hợp của tôi là phiên bản 9.1) và để nguyên phiên bản mới (phiên bản 10.2). Tôi đã sử dụng lệnh tẩy như sau:

sudo apt-get purge libcudart9.1 nvidia-cuda-dev nvidia-cuda-doc \
                                nvidia-cuda-gdb nvidia-cuda-toolkit

Vui lòng xác minh rằng tên gói phù hợp với phiên bản bạn muốn xóa khỏi cài đặt của mình.

Tôi đã phải chạy lại cmaketừ một BUILDthư mục trống để chuyển hướng tất cả #includevà thư viện đến phiên bản SDK (vì các đường dẫn cũ đã được nướng trong môi trường xây dựng hiện có).

Điều này đang xảy ra vì phiên bản CUDA hiện tại của bạn không hỗ trợ phiên bản GCC hiện tại của bạn. Bạn cần làm như sau:

1. Tìm phiên bản GCC được hỗ trợ (trong trường hợp của tôi là 5 cho CUDA 9)

   • CUDA 4.1: GCC 4.5
   • CUDA 5.0: GCC 4.6
   • CUDA 6.0: GCC 4.7
   • CUDA 7.0: GCC 4.8
   • CUDA 7.5: GCC 4.8
   • CUDA 8: GCC 5.3
   • CUDA 9: GCC 5.5
   • CUDA 9.2: GCC 7
   • CUDA 10.1: GCC 8

2. Cài đặt phiên bản GCC được hỗ trợ

   sudo apt-get install gcc-5
   sudo apt-get install g++-5

3. Thay đổi các liên kết mềm cho GCC trong /usr/binthư mục

   cd /usr/bin
   sudo rm gcc
   sudo rm g++
   sudo ln -s /usr/bin/gcc-5 gcc
   sudo ln -s /usr/bin/g++-5 g++

4. Thay đổi các liên kết mềm cho GCC trong /usr/local/cuda-9.0/binthư mục

   cd /usr/local/cuda-9.0/bin
   sudo rm gcc
   sudo rm g++
   sudo ln -s /usr/bin/gcc-5 gcc
   sudo ln -s /usr/bin/g++-5 g++

5. Thêm -DCUDA_HOST_COMPILER=/usr/bin/gcc-5vào setup.pytệp của bạn , được sử dụng để biên dịch

   if torch.cuda.is_available() and CUDA_HOME is not None:
       extension = CUDAExtension
       sources += source_cuda
       define_macros += [("WITH_CUDA", None)]
       extra_compile_args["nvcc"] = [
           "-DCUDA_HAS_FP16=1",
           "-D__CUDA_NO_HALF_OPERATORS__",
           "-D__CUDA_NO_HALF_CONVERSIONS__",
           "-D__CUDA_NO_HALF2_OPERATORS__",
           "-DCUDA_HOST_COMPILER=/usr/bin/gcc-5"
       ]

6. Xóa thư mục bản dựng cũ

   rm -rd build/

7. Biên dịch lại bằng cách cài đặt CUDAHOSTCXX=/usr/bin/gcc-5

   CUDAHOSTCXX=/usr/bin/gcc-5 python setup.py build develop

Lưu ý: Nếu bạn vẫn gặp gcc: error trying to exec 'cc1plus': execvp: no such file or directorylỗi sau khi làm theo các bước này, hãy thử cài đặt lại GCC như thế này và sau đó biên dịch lại:

sudo apt-get install --reinstall gcc-5
sudo apt-get install --reinstall g++-5

Tín dụng: https://github.com/facebookresearch/maskrcnn-benchmark/issues/25#issuecomment-433382510