Tôi muốn dỡ gói mà không phải khởi động lại R (chủ yếu là vì khởi động lại R khi tôi thử các gói khác nhau, xung đột đang trở nên khó chịu, nhưng có thể hiểu rằng điều này có thể được sử dụng trong một chương trình để sử dụng một chức năng và sau đó là một không gian tên tham khảo có lẽ là một ý tưởng tốt hơn cho việc sử dụng đó).

?library không hiển thị bất kỳ tùy chọn nào sẽ dỡ gói.

Có một gợi ý rằng detachcó thể dỡ bỏ gói, nhưng sau cả hai thất bại:

detach(vegan)

Lỗi trong detach(vegan): nameđối số không hợp lệ

detach("vegan")

Lỗi trong detach("vegan"): nameđối số không hợp lệ

Vì vậy, làm thế nào để tôi dỡ một gói?

Hãy thử điều này (xem ?detachđể biết thêm chi tiết):

detach("package:vegan", unload=TRUE)

Có thể tải nhiều phiên bản của một gói (ví dụ: nếu bạn có phiên bản phát triển và phiên bản ổn định trong các thư viện khác nhau). Để đảm bảo rằng tất cả các bản sao được tách ra, sử dụng chức năng này.

detach_package <- function(pkg, character.only = FALSE)
{
  if(!character.only)
  {
    pkg <- deparse(substitute(pkg))
  }
  search_item <- paste("package", pkg, sep = ":")
  while(search_item %in% search())
  {
    detach(search_item, unload = TRUE, character.only = TRUE)
  }
}

Cách sử dụng là, ví dụ

detach_package(vegan)

hoặc là

detach_package("vegan", TRUE)

Bạn cũng có thể sử dụng unloadNamespacelệnh, như trong:

unloadNamespace("sqldf")

Hàm này tách không gian tên trước khi dỡ nó.

Bạn có thể bỏ chọn nút hộp kiểm trong RStudio (gói).

Tôi đã thử những gì kohske đã viết như một câu trả lời và tôi lại gặp lỗi, vì vậy tôi đã thực hiện một số tìm kiếm và tìm thấy cái này hiệu quả với tôi (R 3.0.2):

require(splines) # package
detach(package:splines)

hoặc cũng

library(splines)
pkg <- "package:splines"
detach(pkg, character.only = TRUE)

Khi bạn đang quay đi quay lại giữa các tập lệnh, đôi khi có thể chỉ cần dỡ gói. Đây là một câu lệnh IF đơn giản sẽ ngăn các cảnh báo sẽ xuất hiện nếu bạn cố gắng dỡ một gói hiện không được tải.

if("package:vegan" %in% search()) detach("package:vegan", unload=TRUE) 

Bao gồm điều này ở đầu một kịch bản có thể hữu ích.

Tôi hy vọng điều đó làm cho ngày của bạn!

detach(package:PackageName) hoạt động và không cần sử dụng dấu ngoặc kép.

Bạn có thể thử tất cả những gì bạn muốn loại bỏ một gói (và tất cả các phụ thuộc mà nó mang theo) bằng cách sử dụng unloadNamespace()nhưng dấu chân bộ nhớ sẽ vẫn còn. Và không,detach("package:,packageName", unload=TRUE, force = TRUE) sẽ không hoạt động.

Từ bảng điều khiển mới hoặc Session > Restart Rkiểm tra bộ nhớ với pryrgói:

pryr::mem_used()

# 40.6 MB   ## This will depend on which packages are loaded obviously (can also fluctuate a bit after the decimal)

Kiểm tra của tôi sessionInfo()

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.1   pryr_0.1.4       magrittr_1.5     tools_3.6.1      Rcpp_1.0.3       stringi_1.4.3    codetools_0.2-16 stringr_1.4.0   
[9] packrat_0.5.0   

Hãy tải Seuratgói và kiểm tra dung lượng bộ nhớ mới :

library(Seurat)
pryr::mem_used()

# 172 MB    ## Likely to change in the future but just to give you an idea

Hãy sử dụng unloadNamespace()để xóa mọi thứ:

unloadNamespace("Seurat")
unloadNamespace("ape")
unloadNamespace("cluster")
unloadNamespace("cowplot")
unloadNamespace("ROCR")
unloadNamespace("gplots")
unloadNamespace("caTools")
unloadNamespace("bitops")
unloadNamespace("fitdistrplus")
unloadNamespace("RColorBrewer")
unloadNamespace("sctransform")
unloadNamespace("future.apply")
unloadNamespace("future")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("ggrepel")
unloadNamespace("ggridges")
unloadNamespace("ggplot2")
unloadNamespace("gridExtra")
unloadNamespace("gtable")
unloadNamespace("uwot")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("reticulate")
unloadNamespace("rsvd")
unloadNamespace("survival")
unloadNamespace("Matrix")
unloadNamespace("nlme")
unloadNamespace("lmtest")
unloadNamespace("zoo")
unloadNamespace("metap")
unloadNamespace("lattice")
unloadNamespace("grid")
unloadNamespace("httr")
unloadNamespace("ica")
unloadNamespace("igraph")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("KernSmooth")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("MASS")
unloadNamespace("pbapply")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("png")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("RcppAnnoy")
unloadNamespace("tidyr")
unloadNamespace("dplyr")
unloadNamespace("tibble")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("tidyselect")
unloadNamespace("purrr")
unloadNamespace("htmlwidgets")
unloadNamespace("htmltools")
unloadNamespace("lifecycle")
unloadNamespace("pillar")
unloadNamespace("vctrs")
unloadNamespace("rlang")
unloadNamespace("Rtsne")
unloadNamespace("SDMTools")
unloadNamespace("Rdpack")
unloadNamespace("bibtex")
unloadNamespace("tsne")
unloadNamespace("backports")
unloadNamespace("R6")
unloadNamespace("lazyeval")
unloadNamespace("scales")
unloadNamespace("munsell")
unloadNamespace("colorspace")
unloadNamespace("npsurv")
unloadNamespace("compiler")
unloadNamespace("digest")
unloadNamespace("R.utils")
unloadNamespace("pkgconfig")
unloadNamespace("gbRd")
unloadNamespace("parallel")
unloadNamespace("gdata")
unloadNamespace("listenv")
unloadNamespace("crayon")
unloadNamespace("splines")
unloadNamespace("zeallot")
unloadNamespace("reshape")
unloadNamespace("glue")
unloadNamespace("lsei")
unloadNamespace("RcppParallel")
unloadNamespace("data.table")
unloadNamespace("viridisLite")
unloadNamespace("globals")

Bây giờ hãy kiểm tra sessionInfo():

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] tools_3.6.1       stringr_1.4.0     rstudioapi_0.10   pryr_0.1.4        jsonlite_1.6      gtools_3.8.1      R.oo_1.22.0      
 [8] magrittr_1.5      Rcpp_1.0.3        R.methodsS3_1.7.1 stringi_1.4.3     plyr_1.8.4        reshape2_1.4.3    codetools_0.2-16 
[15] packrat_0.5.0     assertthat_0.2.1 

Kiểm tra dấu chân bộ nhớ :

pryr::mem_used()

# 173 MB

Liên kết đến trình diễn màn hình

Tôi muốn thêm một giải pháp thay thế. Giải pháp này không trả lời trực tiếp câu hỏi của bạn về việc dỡ gói hàng, nhưng IMHO, cung cấp một giải pháp thay thế sạch hơn để đạt được mục tiêu mong muốn của bạn, mà tôi hiểu, quan tâm rộng rãi đến việc tránh xung đột tên và thử các chức năng khác nhau, như đã nêu:

chủ yếu là vì khởi động lại R khi tôi thử các gói khác nhau, xung đột đang trở nên khó chịu, nhưng có thể hiểu rằng điều này có thể được sử dụng trong một chương trình để sử dụng một chức năng và sau đó là một chức năng khác - mặc dù tham chiếu không gian tên có lẽ là một ý tưởng tốt hơn cho việc sử dụng đó

Giải pháp

Chức năng with_packageđược cung cấp thông qua withrgói cung cấp khả năng:

tùy chỉnh một gói vào đường dẫn tìm kiếm, thực thi mã, sau đó xóa gói khỏi đường dẫn tìm kiếm. Không gian tên gói là không bốc dỡ, tuy nhiên.

Thí dụ

library(withr)
with_package("ggplot2", {
  ggplot(mtcars) + geom_point(aes(wt, hp))
})
# Calling geom_point outside withr context 
exists("geom_point")
# [1] FALSE

geom_pointđược sử dụng trong ví dụ không thể truy cập từ không gian tên toàn cầu. Tôi cho rằng nó có thể là một cách xử lý xung đột sạch hơn so với tải và dỡ gói.

Cũng lưu ý rằng bạn chỉ có thể sử dụng unload()một lần. Nếu bạn sử dụng nó lần thứ hai mà không chạy lại library(), bạn sẽ nhận được đối số ' thông tin lỗi không có nhiều thông tin không hợp lệ :

library(vegan)
#> Loading required package: permute
#> Loading required package: lattice
#> This is vegan 2.5-6
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
#> Error in detach("package:vegan", unload = TRUE): invalid 'name' argument

^{Được tạo vào ngày 2020-05-09 bởi gói reprex (v0.3.0)}

Chỉ cần đi đến cửa sổ OUTPUT, sau đó nhấp vào biểu tượng Gói (nó nằm giữa biểu tượng Lô và Trợ giúp ). Xóa " đánh dấu / đánh dấu " khỏi gói bạn muốn được dỡ xuống.

Để sử dụng lại gói, chỉ cần đặt " đánh dấu hoặc Dấu kiểm " trước gói hoặc sử dụng:

library (lme4)

Một lựa chọn khác là

devtools::unload("your-package")

Điều này rõ ràng cũng liên quan đến vấn đề các phương thức S3 đã đăng ký không bị xóa bằngunloadNamespace()