Tôi đã triển khai một bộ giải Euler lạc hậu trong python 3 (sử dụng numpy). Để thuận tiện cho bản thân và như một bài tập, tôi cũng đã viết một hàm nhỏ tính toán xấp xỉ sai phân hữu hạn của độ dốc để tôi không phải luôn xác định Jacobian một cách phân tích (nếu có thể!).
Sử dụng các mô tả được cung cấp trong Ascher và Petzold 1998 , tôi đã viết hàm này xác định độ dốc tại một điểm x:
def jacobian(f,x,d=4):
'''computes the gradient (Jacobian) at a point for a multivariate function.
f: function for which the gradient is to be computed
x: position vector of the point for which the gradient is to be computed
d: parameter to determine perturbation value eps, where eps = 10^(-d).
See Ascher und Petzold 1998 p.54'''
x = x.astype(np.float64,copy=False)
n = np.size(x)
t = 1 # Placeholder for the time step
jac = np.zeros([n,n])
eps = 10**(-d)
for j in np.arange(0,n):
yhat = x.copy()
ytilde = x.copy()
yhat[j] = yhat[j]+eps
ytilde[j] = ytilde[j]-eps
jac[:,j] = 1/(2*eps)*(f(t,yhat)-f(t,ytilde))
return jac
Tôi đã kiểm tra hàm này bằng cách lấy hàm đa biến cho con lắc và so sánh Jacobian tượng trưng với độ dốc được xác định bằng số cho một loạt các điểm. Tôi rất hài lòng với kết quả kiểm tra, lỗi là khoảng 1e-10. Khi tôi giải ODE cho con lắc bằng Jacobian gần đúng, nó cũng hoạt động rất tốt; Tôi không thể phát hiện bất kỳ sự khác biệt giữa hai.
Sau đó, tôi đã thử kiểm tra nó với PDE sau (phương trình của Fisher trong 1D):
sử dụng một sự khác biệt hữu hạn.
Bây giờ phương pháp của Newton nổ tung trong dấu thời gian đầu tiên:
/home/sfbosch/Fisher-Equation.py:40: RuntimeWarning: overflow encountered in multiply
du = (k/(h**2))*np.dot(K,u) + lmbda*(u*(C-u))
./newton.py:31: RuntimeWarning: invalid value encountered in subtract
jac[:,j] = 1/(2*eps)*(f(t,yhut)-f(t,yschlange))
Traceback (most recent call last):
File "/home/sfbosch/Fisher-Equation.py", line 104, in <module>
fisher1d(ts,dt,h,L,k,C,lmbda)
File "/home/sfbosch/Fisher-Equation.py", line 64, in fisher1d
t,xl = euler.implizit(fisherode,ts,u0,dt)
File "./euler.py", line 47, in implizit
yi = nt.newton(g,y,maxiter,tol,Jg)
File "./newton.py", line 54, in newton
dx = la.solve(A,b)
File "/usr/lib64/python3.3/site-packages/scipy/linalg/basic.py", line 73, in solve
a1, b1 = map(np.asarray_chkfinite,(a,b))
File "/usr/lib64/python3.3/site-packages/numpy/lib/function_base.py", line 613, in asarray_chkfinite
"array must not contain infs or NaNs")
ValueError: array must not contain infs or NaNs
Điều này xảy ra với nhiều giá trị eps, nhưng thật kỳ lạ, chỉ khi kích thước bước không gian PDE và kích thước bước thời gian được đặt sao cho không đáp ứng điều kiện Courant cảm Friedrichs Friedrich Lewy. Nếu không thì nó hoạt động. (Đây là hành vi bạn mong đợi nếu giải quyết bằng Euler chuyển tiếp!)
Để hoàn thiện, đây là chức năng của Phương pháp Newton:
def newton(f,x0,maxiter=160,tol=1e-4,jac=jacobian):
'''Newton's Method.
f: function to be evaluated
x0: initial value for the iteration
maxiter: maximum number of iterations (default 160)
tol: error tolerance (default 1e-4)
jac: the gradient function (Jacobian) where jac(fun,x)'''
x = x0
err = tol + 1
k = 0
t = 1 # Placeholder for the time step
while err > tol and k < maxiter:
A = jac(f,x)
b = -f(t,x)
dx = la.solve(A,b)
x = x + dx
k = k + 1
err = np.linalg.norm(dx)
if k >= maxiter:
print("Maxiter reached. Result may be inaccurate.")
print("k = %d" % k)
return x
(Hàm la.solve là scipy.linalg.solve.)
Tôi tin tưởng rằng việc triển khai Euler lạc hậu của tôi là theo thứ tự, bởi vì tôi đã thử nghiệm nó bằng cách sử dụng một chức năng cho Jacobian và nhận được kết quả ổn định.
Tôi có thể thấy trong trình gỡ lỗi rằng newton () quản lý 35 lần lặp trước khi xảy ra lỗi. Con số này vẫn giữ nguyên cho mỗi eps tôi đã thử.
Một quan sát bổ sung: khi tôi tính toán độ dốc với FDA và một hàm sử dụng điều kiện ban đầu làm đầu vào và so sánh hai trong khi thay đổi kích thước của epsilon, lỗi sẽ tăng lên khi epsilon co lại. Tôi dự kiến nó sẽ lớn lúc đầu, sau đó nhỏ hơn, sau đó lại lớn hơn khi epsilon co lại. Vì vậy, một lỗi trong việc triển khai Jacobian của tôi là một giả định hợp lý, nhưng nếu vậy, nó tinh tế đến mức tôi không thể nhìn thấy nó. EDIT: Tôi đã sửa đổi jacobian () để sử dụng chuyển tiếp thay vì các khác biệt trung tâm và bây giờ tôi quan sát sự phát triển dự kiến của lỗi. Tuy nhiên, newton () vẫn không hội tụ. Quan sát dx trong phép lặp Newton, tôi thấy rằng nó chỉ phát triển, thậm chí không có biến động: nó gần gấp đôi (yếu tố 1.9) với mỗi bước, với yếu tố ngày càng lớn hơn.
Ascher và Petzold có đề cập rằng các xấp xỉ khác nhau cho Jacobian không phải lúc nào cũng hoạt động tốt. Một Jacobian gần đúng với sự khác biệt hữu hạn có thể gây ra sự mất ổn định trong phương pháp của Newton không? Hay là nguyên nhân ở một nơi khác? Làm thế nào khác tôi có thể tiếp cận vấn đề này?