Tôi đang theo dõi một khóa học về thống kê Bayes bằng cách sử dụng BUGS và R. Bây giờ, tôi đã biết BUGS, thật tuyệt nhưng tôi không thực sự thích sử dụng một chương trình riêng biệt thay vì chỉ R.
Tôi đã đọc được rằng có rất nhiều gói Bayesian mới trong R. Có một danh sách hoặc tài liệu tham khảo về những gói nào dành cho thống kê Bayes không và chúng làm gì? Và, có một gói R thay thế cho tính linh hoạt của BUGS không?
Câu trả lời:
Bạn có thể xem gói MCMCglmm đi kèm với các họa tiết rất đẹp. Cũng có một bayesglm()chức năng để phù hợp với các mô hình tuyến tính tổng quát Bayes trong gói cánh tay , bởi Andrew Gelman. Tôi cũng đã nghe nói về một bản phát hành blmer / bglmerchức năng trong tương lai cho mô hình phân cấp trong cùng một gói.
Một vài người tôi biết đã và đang sử dụng JAGS . Cú pháp JAGS tương tự như BUGS.
Hiệu suất là lý do chính khiến mọi người sử dụng WinBUGS / OpenBUGS / JAGS so với các gói như MCMglmm. Nó là rất khó khăn không thực tế để viết một Gibbs sampler hiệu quả trong R. mẹ đẻ Có gói cho phép bạn chạy LỖI mô hình từ một kịch bản R, đáng chú ý RBUGS và BUGSParallel .
MCMCglammlà một ví dụ tồi vì "mô phỏng [a] ll được thực hiện trong C / C ++ bằng thư viện CSparse cho các hệ thống tuyến tính thưa thớt" (xem tóm tắt ).