Các mô hình nguy hiểm thời gian riêng biệt (guốc) trong R


10

Các survivalgói trong Rdường như tập trung vào các mô hình sống sót thời gian liên tục. Tôi quan tâm đến việc ước tính một phiên bản thời gian riêng biệt của một mô hình rủi ro tỷ lệ, mô hình log-log bổ sung. Tôi có một mô hình sinh tồn khá đơn giản, với sự kiểm duyệt đơn giản.

Tôi biết rằng một cách để ước tính mô hình này là tạo một tập dữ liệu có một hàng riêng cho mỗi lần quan sát cho từng giai đoạn mà nó không "chết". Sau đó, một glmmô hình với cloglogliên kết có thể được sử dụng.

Cách tiếp cận này có vẻ rất kém hiệu quả bộ nhớ; thật vậy, nó có thể sẽ tạo ra một tập dữ liệu quá lớn cho bộ nhớ trong máy của tôi.

Cách tiếp cận thứ hai sẽ là tự mình viết mã MLE. Điều đó đủ đơn giản, nhưng tôi hy vọng rằng có một gói có mô hình sinh tồn này đóng hộp. Nó sẽ chỉ dễ dàng hơn cho sự hợp tác và để tránh các lỗi mã hóa để sử dụng một gói.

Có ai biết một gói như vậy?


2
Nếu đây là thời gian riêng biệt, bạn phải có rất nhiều mối quan hệ, phải không? Tôi có ấn tượng rằng coxph(ties="exact"), trong survivalgói tiêu chuẩn , làm cho mô hình "một mô hình logistic có điều kiện và phù hợp khi thời gian là một tập hợp nhỏ các giá trị rời rạc". Điều này sẽ không làm việc cho bạn? Đó có phải là nó sẽ không được sử dụng cloglogliên kết?
gung - Tái lập Monica

1
@gung, Cảm ơn con trỏ; Tôi không biết về tính năng đó. Tôi muốn sử dụng các cloglogliên kết, mặc dù.
Charlie

Câu trả lời:


8

Có một số hàng cho mỗi quan sát có vẻ dư thừa, nhưng, có thể, không phải vậy. Nếu có bất kỳ đồng biến thời gian nào trong mô hình, thì mỗi tháng quan sát chắc chắn sẽ cần hàng riêng. Một ví dụ cụ thể về hiệp phương sai thời gian là thời gian trôi qua. Do biến này gần như chắc chắn được đưa vào mô hình, nên có một hàng riêng cho mỗi giai đoạn quan sát. Vì vậy, cách tiếp cận đầu tiên được đề xuất có khả năng là cách tốt nhất.

Lưu ý rằng điều này khác với mô hình mối nguy theo tỷ lệ thời gian liên tục với phân phối Weibull. Ở đó, mô hình sinh tồn có thể được đơn giản hóa thành một dòng duy nhất cho mỗi lần quan sát nếu thời gian trôi qua là hiệp phương sai duy nhất theo thời gian ( ví dụ, xem ở đây ). Một kết quả tương tự giữ cho mô hình nguy cơ tỷ lệ Cox.

Khi sử dụng trang web của chúng tôi, bạn xác nhận rằng bạn đã đọc và hiểu Chính sách cookieChính sách bảo mật của chúng tôi.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.