Một số người tin rằng Microsoft giữ bằng sáng chế phần mềm đối với các khía cạnh của .NET và khi triển khai .NET, Mono vi phạm các bằng sáng chế đó. Do đó, những người này cảm thấy rằng việc sử dụng Mono có thể để ngỏ cho các vụ kiện bằng sáng chế.
Tôi cho rằng Mono rất gây tranh cãi bởi vì luật sáng chế nói chung là gây tranh cãi. Nhưng sau đó, có những trường hợp cụ thể trong đó các thực thể thúc đẩy Mono đã đưa ra các thỏa thuận với Microsoft trông rất giống các thỏa thuận bằng sáng chế, sau đó có thể được nhìn thấy để củng cố lập luận của Microsoft về tính hợp lệ của bất kỳ bằng sáng chế nào. (Tất nhiên, Microsoft đã không thực sự cung cấp bất kỳ bằng chứng nào cho thấy các bằng sáng chế tồn tại, do đó duy trì trạng thái không chắc chắn, giống như yêu cầu của họ về các bằng sáng chế bị vi phạm bởi hạt nhân linux.) Những thỏa thuận này dẫn đến cảm giác bị phản bội và mất lòng tin từ cộng đồng khác các thành viên, vì thỏa thuận dường như làm tổn thương toàn bộ cộng đồng (bằng cách tăng rủi ro bằng sáng chế) đồng thời mang lại lợi ích cho đơn vị thực hiện thỏa thuận với Microsoft. Vì vậy, điều đó dẫn đến một lý do khác khiến Mono gây tranh cãi:
Nhân tiện, tôi nên đề cập rằng tôi viết từ góc nhìn của một khán giả, và tôi không có kiến thức chi tiết hoặc cụ thể về toàn bộ tình huống. Tôi đã cố gắng duy trì sự thiên vị và chủ yếu tránh những danh từ riêng để tránh kéo câu hỏi này vào cuộc tranh cãi mà nó hỏi.
Chỉnh sửa: Trong các bình luận, ai đó đã chỉ ra rằng Microsoft có một lời hứa cộng đồng không khẳng định quyền sáng chế chống lại việc triển khai .NET. Nhưng lời hứa có đủ tính hợp pháp trong đó mà tôi không cảm thấy mình thực sự có thể chắc chắn rằng lời hứa đó bảo vệ chặt chẽ mà không cần thuê luật sư để vượt qua. Sau khi đọc nó, tôi có thể nghĩ ra một số lỗ hổng tiềm năng có thể cho phép Microsoft khẳng định quyền sáng chế đối với Mono, nhưng kể từ IANAL , tôi không biết liệu bất kỳ lỗ hổng nào trong số này có thể được bảo vệ về mặt pháp lý hay chỉ là sự hiểu lầm của tôi về pháp lý của Microsoft. Vì vậy, trong khi lời hứa của cộng đồng là đáng khích lệ, chắc chắn nó không thể chấm dứt tranh cãi giữa trách nhiệm bằng sáng chế có thể của Mono.