Làm thế nào để cài đặt pydot và graphviz?

Tôi đang chạy một mã cần pydot và graphviz. Tôi đang sử dụng python 3.5 và ubfox 16.04 LTS 64 bit.

  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/keras/utils/vis_utils.py", line 17, in _check_pydot
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
ImportError: Failed to import pydot. You must install pydot and graphviz for `pydotprint` to work.

Tôi googled một chút sau đó thấy rằng tôi có thể cài đặt pydot với mã pip install pydot. Nhưng tôi biết nhận được lỗi này. Tôi không biết gì về Ubuntu và tôi không hiểu phải làm gì. Vậy làm cách nào để cài đặt pydot?

deeplearning@deep-learning-virtual-machine:~$ pip install pydot
Collecting pydot
Collecting pyparsing>=2.1.4 (from pydot)
  Using cached pyparsing-2.2.0-py2.py3-none-any.whl
Installing collected packages: pyparsing, pydot
  Found existing installation: pyparsing 2.0.3
    Uninstalling pyparsing-2.0.3:
Exception:
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/lib/python3.5/shutil.py", line 538, in move
    os.rename(src, real_dst)
PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/usr/lib/python3/dist-packages/__pycache__/pyparsing.cpython-35.pyc' -> '/tmp/pip-45miiuxw-uninstall/usr/lib/python3/dist-packages/__pycache__/pyparsing.cpython-35.pyc'

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/basecommand.py", line 215, in main
    status = self.run(options, args)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/commands/install.py", line 342, in run
    prefix=options.prefix_path,
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/req/req_set.py", line 778, in install
    requirement.uninstall(auto_confirm=True)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/req/req_install.py", line 754, in uninstall
    paths_to_remove.remove(auto_confirm)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/req/req_uninstall.py", line 115, in remove
    renames(path, new_path)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pip/utils/__init__.py", line 267, in renames
    shutil.move(old, new)
  File "/usr/lib/python3.5/shutil.py", line 553, in move
    os.unlink(src)
PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/usr/lib/python3/dist-packages/__pycache__/pyparsing.cpython-35.pyc'

python-pydot và graphviz nằm trong kho Ubuntu mặc định trong tất cả các phiên bản Ubuntu hiện được hỗ trợ. Trong tất cả các phiên bản hiện đang được hỗ trợ của Ubuntu, hãy mở thiết bị đầu cuối và gõ:

sudo apt install python-pydot python-pydot-ng graphviz # python-pydot-ng isn't in the 14.04 repos

Lưu đồ này được tạo ra với graphviz trong Ubuntu. Vì graphviz sử dụng ngôn ngữ lập trình chấm tích hợp có trong gói graphviz, mã nguồn của sơ đồ liên kết có thể chỉnh sửa trong bất kỳ trình soạn thảo văn bản nào ngay cả khi python-pydot không được cài đặt.

Tôi không biết tại sao bạn muốn cài đặt pydot với pip khi bạn có thể lấy nó từ kho Ubuntu, nhưng để trả lời câu hỏi của bạn, tôi đã thử cài đặt pydot trong môi trường ảo Python pip3 install pydotvà nó đã hoạt động, vì vậy có thể là bạn cần cập nhật pip lên phiên bản mới nhất với sudo -H pip3 install --upgrade pip. Tôi đã sử dụng pip3thay pipvì bởi vì bạn đã viết trong câu hỏi của bạn rằng bạn đang sử dụng Python 3.5.

Từ câu trả lời này về "Cài đặt gói pydot và graphviz trong môi trường Anaconda"

Tôi đã có cùng một vấn đề và giải quyết nó bằng cách (thứ tự là quan trọng ):

1. Cài đặt graphviz, chỉ cần thông quasudo apt-get install graphviz
2. Cài đặt graphvizcho Python qua condasudo ~/anaconda2/bin/conda install graphviz
3. Cuối cùng, bằng cách cài đặt pydotbằng condasudo ~/anaconda2/bin/conda install pydot

Câu trả lời này đã quá hạn nhưng bài đăng này đã giúp tôi (cùng với bài này đề cập đến thứ tự cài đặt), vì vậy hy vọng câu trả lời này sẽ giúp được người khác. Tôi đang sử dụng Ubuntu 14.04 và Python 2.7.

PS rõ ràng, có thể có một số vấn đề với bước 1 của thuật toán trên, bài đăng này đề cập đến cách khắc phục chúng.

Bởi vì bạn sử dụng python 3, lệnh đúng sẽ là pip3 install pydot graphviz. Bạn có thể cài đặt pip3 bằng cách sử dụng sudo apt install python3-pip.

Trên Ubuntu 17.10, ff đã khắc phục sự cố:

sudo apt-get install python3-pydot graphviz
sudo pip3 install pydot_ng