tạm dừng một tập lệnh bash cho đến khi các lệnh trước kết thúc

Tôi có một tập lệnh bash trông giống như sau:

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

Tôi muốn tạo một vòng lặp khác sau vòng đầu tiên để tiếp tục cho 30. Ví dụ:

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

Tôi muốn bộ công việc đầu tiên kết thúc trước khi bắt đầu bộ công việc mới. Nhưng vì nohupcó vẻ như tất cả chúng đều chạy cùng một lúc.

Tôi có nohupbởi vì tôi đăng nhập từ xa vào máy chủ của mình và bắt đầu các công việc ở đó và sau đó đóng bash của tôi. Có một giải pháp thay thế?

Bạn sẽ muốn sử dụng waitlệnh để làm điều này cho bạn. Bạn có thể nắm bắt tất cả các ID xử lý con và chờ chúng một cách cụ thể hoặc nếu chúng là các tiến trình nền duy nhất mà tập lệnh của bạn đang tạo, bạn chỉ có thể gọi waitmà không cần đối số. Ví dụ:

#!/bin/bash
# run two processes in the background and wait for them to finish

nohup sleep 3 &
nohup sleep 10 &

echo "This will wait until both are done"
date
wait
date
echo "Done"

Một vài điểm:

• Nếu mục tiêu của bạn nohuplà ngăn chặn một lối thoát shell từ xa giết chết các tiến trình worker của bạn, bạn nên sử dụng nohuptrên chính script, chứ không phải trên các process worker riêng lẻ mà nó tạo ra.

• Như đã giải thích ở đây , nohupchỉ ngăn các quá trình nhận SIGHUP và tương tác với thiết bị đầu cuối, nhưng nó không phá vỡ mối quan hệ giữa hệ vỏ và các tiến trình con của nó.

• Do điểm trên, có hoặc không có nohup, một đơn giản waitgiữa hai forvòng sẽ khiến lần thứ hai forchỉ được thực hiện sau khi tất cả các tiến trình con được bắt đầu bởi lần đầu tiên forđã thoát.

• Với một cách đơn giản wait:

  tất cả các tiến trình con hiện đang hoạt động được chờ đợi và trạng thái trả về bằng không.

• Nếu bạn chỉ cần chạy lần thứ hai fornếu không có lỗi nào trong lần đầu tiên, thì bạn sẽ cần lưu từng công nhân PID với $!và chuyển tất cả chúng sang wait:

  pids=
  for ...
      worker ... &
      pids+=" $!"
  done
  wait $pids || { echo "there were errors" >&2; exit 1; }

Sử dụng fgnội dung. Nó chờ cho đến khi quá trình nền kết thúc.

Hãy thử help fgđể biết chi tiết.

Nếu bạn chèn một cái gì đó như đoạn mã sau vào giữa hai forvòng của bạn , nó có thể giúp ích.

flag=0

while [ flag -eq 0 ]
do
  ps -ef | grep "Rscript --vanilla" | grep -v grep > /dev/null
  flag=${?}
  sleep 10
done

Tất nhiên, nếu ứng dụng của bạn Rscriptcó cơ hội không hoàn thành thành công và tồn tại xung quanh, vòng lặp thứ hai của bạn có thể không có cơ hội để chạy. Đoạn mã ở trên giả định, tất cả các quy trình với mã định danh Rscript --vanillasẽ hoàn thành và biến mất đúng cách. Không biết ứng dụng của bạn làm gì và nó chạy như thế nào, tôi phải dựa vào giả định này.

CHỈNH SỬA

Trong ánh sáng của các ý kiến, điều này sẽ phù hợp hơn với nhu cầu của bạn. (nó bao gồm mã gốc của bạn cũng như logic kiểm tra hoàn thành)

for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
pids[$i]=${!}
done

flag=0

while [ flag -eq 0 ] 
do
  for PID in $(echo ${pids[@]})
  do
    flag=1
    ps -ef | grep ${PID} | grep -v grep >/dev/null; r=${?}
    if [ ${r} -eq 0 ]
    then 
      flag=0
    fi
  done
done

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done