Đúng. Trừ khi bạn mua ứng dụng thông qua App Store, chúng sẽ không phải là ứng dụng chính thức của App Store. Có nghĩa là không cần cài đặt lại nếu bạn cần, không cài đặt trên các máy Mac khác, v.v. Và bạn sẽ không nhận được các bản cập nhật thông qua App Store, bạn sẽ nhận được các bản cập nhật thông qua Cập nhật phần mềm (bạn có thể tìm thấy trong Tùy chọn hệ thống).
Tuy nhiên, nếu / khi bạn nâng cấp lên Mountain Lion, được phát hành vào tuần trước, Cập nhật phần mềm đã được tích hợp vào App Store. Vì vậy, tất cả phần mềm Apple của bạn, bất kể có được mua thông qua App Store hay không, đều được cập nhật ở một nơi.