Cài đặt SciPy và NumPy bằng pip

Tôi đang cố gắng tạo các thư viện cần thiết trong một gói tôi đang phân phối. Nó đòi hỏi cả thư viện SciPy và NumPy . Trong khi phát triển, tôi đã cài đặt cả hai bằng cách sử dụng

apt-get install scipy

đã cài đặt SciPy 0.9.0 và NumPy 1.5.1 và nó hoạt động tốt.

Tôi cũng muốn làm như vậy bằng cách sử dụng pip install- để có thể chỉ định các phụ thuộc trong một thiết lập gói của chính tôi.

Vấn đề là, khi tôi cố gắng:

pip install 'numpy==1.5.1'

nó hoạt động tốt.

Nhưng sau đó

pip install 'scipy==0.9.0'

thất bại thảm hại, với

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Làm thế nào để tôi làm cho nó hoạt động?

Tôi giả sử kinh nghiệm Linux trong câu trả lời của tôi; Tôi thấy rằng có ba điều kiện tiên quyết pip install scipyđể tiến hành tốt đẹp.

Tới đây: Cài đặt SciPY

Làm theo các hướng dẫn để tải xuống, xây dựng và xuất biến env cho BLAS và sau đó LAPACK . Hãy cẩn thận để không chỉ cắt một cách mù quáng các lệnh shell - sẽ có một vài dòng bạn cần chọn tùy thuộc vào kiến ​​trúc của bạn, v.v., và bạn sẽ cần sửa / thêm các thư mục chính xác mà nó giả định không chính xác như tốt.

Điều thứ ba bạn có thể cần là cài đặt numpy-f2py hoặc tương đương.

Ồ, vâng và cuối cùng, bạn có thể cần phải cài đặt gcc-gfortran vì các thư viện ở trên là nguồn Fortran .

Điều này làm việc cho tôi trên Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

bạn cần các gói dev libblas và liblapack nếu bạn đang sử dụng Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Vì các hướng dẫn trước đây để cài đặt với yum bị hỏng nên đây là các hướng dẫn được cập nhật để cài đặt trên một cái gì đó như fedora. Tôi đã thử nghiệm điều này trên "Amazon Linux AMI 2016.03"

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Tôi đang làm việc trong một dự án phụ thuộc vào numpy và scipy. Trong bản cài đặt sạch Fedora 23, sử dụng môi trường ảo python cho Python 3.4 (cũng hoạt động cho Python 2.7) và với phần sau trong setup.py của tôi (trong setup()phương thức)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

Tôi thấy tôi phải chạy như sau để đi pip install -e .làm:

pip install --upgrade pip

và

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

Việc redhat-rpm-configsử dụng của Scipy redhat-hardened-cc1trái ngược với thông thườngcc1

Trên windows python 3.5 , tôi quản lý để cài đặt scipybằng cách conda không sử dụng pip:

conda install scipy

Hệ điều hành này là gì? Câu trả lời có thể phụ thuộc vào HĐH liên quan. Tuy nhiên, có vẻ như bạn cần tìm thư viện BLAS này và cài đặt nó. Nó dường như không có trong PIP (do đó bạn sẽ phải thực hiện bằng tay), nhưng nếu bạn cài đặt nó, nó sẽ cho phép bạn tiến hành cài đặt SciPy.

trong trường hợp của tôi, nâng cấp pip đã làm điều đó. Ngoài ra, tôi đã cài đặt scipy với tham số -U (nâng cấp tất cả các gói lên phiên bản có sẵn mới nhất)