lỗi pydot và graphviz: Không thể nhập dot_parser, không thể tải các tệp dot

Khi tôi chạy một mã rất đơn giản với pydot

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Nó in cho tôi thông báo lỗi:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Tôi đang sử dụng python 2.7.3

Câu trả lời cho pydot >= 1.1 :

Sự không tương thích của (ngược dòng) pydotđã được 6dff94b3f1 khắc phục và do đó pydot >= 1.1sẽ tương thích vớipyparsing >= 1.5.7 .

Câu trả lời áp dụng cho pydot <= 1.0.28 :

Đối với bất kỳ ai khác gặp phải điều này, đó là do những thay đổi trong pyparsing từ 1.x sang 2.x phát hành. Để cài đặt pydot bằng pip, trước tiên hãy cài đặt phiên bản pyparsing cũ hơn:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

Nếu bạn không cài đặt pyparsingbằng cách sử dụng pipmà thay vào đó đã sử dụng setup.py, thì hãy xem giải pháp gỡ cài đặt gói này. Cảm ơn @qtips.

Có một gói mới trong pip repo được gọi là pydot2 hoạt động chính xác với pyparsing2. Tôi không thể hạ cấp các gói của mình vì matplotlib phụ thuộc vào gói pyparsing mới hơn.

Lưu ý: python2.7 từ macports

pydot đã sử dụng một biến mô-đun riêng (_noncomma) từ pyparsing. Khác biệt bên dưới sửa nó để sử dụng cho pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Tôi đã tách kho lưu trữ pydot [1], áp dụng bản vá Gabi Davar và một số thay đổi để hỗ trợ python-3. Gói này có sẵn trong PyPI [2].

Chúc mừng

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Xem liên kết sau: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Giải pháp không phải là cài đặt pydot từ đâu đó, mà là "python-pydot" từ kho lưu trữ ubuntu chính thức.

Hiện đã có thêm ít nhất 2 phiên bản hỗ trợ PyParsing-2 và Python-3:

• PyDotPlus của Carlos Jenkins với một công cụ xây dựng travis đẹp mắt và tài liệu lạ mắt . Tuy nhiên, bạn sẽ cần phải thay đổi tên thư mục của nó từ site-packages\pydotplusthành site-packages\pydotđể nó hoạt động với các chương trình hiện có nhập pydot.
• pydot3k bởi bmcorser . Đáng buồn thay, không hoạt động!
• prologic / pydot của James Mills được liên kết đến từ trang mã pydot chính thức của Google là ...

  một nhánh để tương thích với Python 3

• và đây là một liên kết hoạt động đến pydot2 của David Villa, hoạt động tốt: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

Tôi lại gặp sự cố và giải pháp trên của tôi không hoạt động. Nếu điều đó đúng với bạn và bạn cũng đang sử dụng Anaconda trên máy Mac với El Capitan, hãy thử cách này:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Những gì tôi đã làm cuối cùng sau rất nhiều lần thử từ những gì tôi đã thấy ở đây (chuỗi giả để nó hoạt động cho networkx):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Điều này làm việc cho tôi (Mac OS X 10.9 với Python 2.7.10 trên Anaconda):

conda uninstall pydot

Sau đó,

conda install pydot

Pyparsing sau đó bị hạ cấp (từ 2.x xuống 1.5.7) khi cài đặt pydot. Nhân viên Google tương lai: điều này cho phép tôi cài đặt và nhập Theano một cách chính xác.

Trên OSX Mavericks, phần sau đã thực hiện thủ thuật ... Tôi gặp lỗi tương tự nhưng ở phía dưới cũng có khiếu nại rằng tệp thực thi graphviz không hiển thị ... Tôi nghĩ vấn đề là tôi đã cài đặt graphviz trước các mô-đun khác?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Khi các giải pháp khác không hoạt động, đây là một phương pháp nhanh chóng và bẩn thỉu để giải quyết vấn đề:

Ví dụ này là từ python 2.7 trên Ubuntu 16.04.

Chỉnh sửa tệp python2.7 / site-package / keras / utils / visual_util.py và nhận xét đoạn mã bên dưới.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () là dư thừa trên các phiên bản mới hơn của pydot và lệnh gọi trên không hoạt động.

Tôi cũng đã gặp sự cố và pydot của tôi == 1.0.28 trong khi pyparsing == 2.2.0. Tôi đã khắc phục sự cố bằng cách tải xuống pydot 1.2.3 (tar.gz) mới nhất từ ​​google và sau đó cài đặt nó ngoại tuyến. Khi tôi cập nhật pydot trong ubuntu 14.04, nó cho biết pydot 1.0.28 là phiên bản mới nhất. Do đó tôi tải xuống từ google phiên bản 1.2.3.

Bạn cần hạ cấp pyparsing từ phiên bản 2.x xuống phiên bản 1.5.7 để pydot hoạt động chính xác.

Đối với win-64, sử dụng Conda, điều này phù hợp với tôi:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Sau đó, tôi đã tắt / gỡ cài đặt phiên bản 2.x và tải lại pyparsing trong tập lệnh của mình:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

Để kiểm tra xem bạn có phiên bản phù hợp đang chạy hay không:

print pyparsing.__version__