Tạo một PNG với matplotlib khi HIỂN THỊ không xác định

Tôi đang cố gắng sử dụng networkx với Python. Khi tôi chạy chương trình này, nó nhận được lỗi này. Có thiếu gì không?

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Bây giờ tôi gặp một lỗi khác:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Bây giờ tôi gặp một lỗi khác:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Vấn đề chính là (trên hệ thống của bạn) matplotlib chọn một phụ trợ x sử dụng theo mặc định. Tôi chỉ gặp vấn đề tương tự trên một trong các máy chủ của mình. Giải pháp cho tôi là thêm đoạn mã sau vào nơi được đọc trước khi nhập bất kỳ pylab / matplotlib / pyplot nào khác :

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

Cách khác là đặt nó trong .matplotlibrc của bạn

Cũng như một phần bổ sung cho câu trả lời của Rebout.

Cách vĩnh viễn để giải quyết loại vấn đề này là chỉnh sửa tệp .matplotlibrc. Tìm nó qua

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

Sau đó sửa đổi phụ trợ trong tập tin đó thành backend : Agg. Thế là xong.

Câu trả lời rõ ràng là dành một chút thời gian chuẩn bị chính xác môi trường thực thi của bạn.

Kỹ thuật đầu tiên bạn phải chuẩn bị môi trường thực thi của mình là sử dụng một matplotlibrctệp, theo khuyến cáo khôn ngoan của Chris Q. , cài đặt

backend : Agg

trong tập tin đó Bạn thậm chí có thể kiểm soát - không có thay đổi mã - cách thức và nơi matplotlib tìm và tìm matplotlibrctệp .

Kỹ thuật thứ hai bạn phải chuẩn bị môi trường thực thi của mình là sử dụng MPLBACKENDbiến môi trường (và thông báo cho người dùng của bạn để sử dụng nó):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

Điều này rất hữu ích vì bạn thậm chí không phải cung cấp một tệp khác trên đĩa để thực hiện công việc này. Tôi đã sử dụng phương pháp này với, ví dụ, thử nghiệm tích hợp liên tục và chạy trên các máy từ xa không có màn hình.

Mã hóa cứng phần phụ trợ matplotlib của bạn thành "Agg" trong mã Python của bạn giống như đâm một cái chốt vuông vào một cái lỗ tròn bằng một cái búa lớn, thay vào đó, khi đó, bạn có thể vừa nói với matplotlib rằng nó cần phải là một lỗ vuông.

Tôi đã gặp lỗi khi sử dụng matplotlib thông qua Spark. matplotlib.use('Agg')không làm việc cho tôi. Cuối cùng, đoạn mã sau hoạt động với tôi. Thêm ở đây

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

Tôi sẽ chỉ nhắc lại những gì @Ivo Bosticky nói có thể bỏ qua. Đặt các dòng này ở đầu RẤT của tệp py.

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

Hoặc người ta sẽ gặp lỗi

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923: UserWarning: Cuộc gọi này đến matplotlib.use () không có hiệu lực
bởi vì phần phụ trợ đã được chọn;
matplotlib.use () phải được gọi * trước * pylab, matplotlib.pyplot, *

Điều này sẽ giải quyết tất cả vấn đề Hiển thị

Tôi thấy đoạn mã này hoạt động tốt khi chuyển đổi giữa môi trường X và không X.

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Khi đăng nhập vào máy chủ để thực thi mã, hãy sử dụng mã này thay thế:

ssh -X username@servername

những -Xsẽ thoát khỏi sự không có tên hiển thị và không có $ DISPLAY biến môi trường lỗi

:)

Bạn đang trên hệ thống nào? Có vẻ như bạn có một hệ thống với X11, nhưng biến môi trường HIỂN THỊ không được đặt đúng. Hãy thử thực hiện lệnh sau và sau đó chạy lại chương trình của bạn:

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Nó làm việc cho tôi.

Một điều khác để kiểm tra là liệu người dùng hiện tại của bạn có được phép kết nối với màn hình X hay không. Trong trường hợp của tôi, root không được phép làm điều đó và matplotlib đã phàn nàn với cùng một lỗi.

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

nguồn: http : //www.debian-ad dùng.org

Để đảm bảo mã của bạn có thể di động trên Windows, Linux và OSX và cho các hệ thống có và không có màn hình, tôi sẽ đề xuất đoạn trích sau:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Tín dụng: https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

Đối với Google Cloud Machine Learning Engine:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

Và sau đó để in thành tập tin:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

và để tạo PDF:

multi_page(report_name)