Thử nghiệm gì để so sánh thành phần cộng đồng?

Hy vọng câu hỏi của người mới này là câu hỏi đúng cho trang web này:

Giả sử tôi muốn so sánh thành phần của các cộng đồng sinh thái ở hai địa điểm A, B. Tôi biết cả ba địa điểm đều có chó, mèo, bò và chim, vì vậy tôi lấy mẫu phong phú của chúng tại mỗi địa điểm (tôi thực sự không có " "sự phong phú cho mỗi động vật tại mỗi địa điểm).

Nếu tôi đếm, giả sử, năm trong số mỗi con vật ở mỗi địa điểm, thì A và B rất "giống nhau" (thực tế, chúng là "giống nhau").

Nhưng nếu tôi tìm thấy 100 con chó, 5 con mèo, 2 con bò và 3 con chim ở địa điểm A. 5 con chó, 3 con mèo, 75 con bò và 2 con chim ở địa điểm B. thì tôi sẽ nói rằng các địa điểm A và B là "không giống nhau" , mặc dù chúng có cùng thành phần loài.

(Tôi đã đọc các chỉ số của Sorensen và Bray-Curtis, nhưng có vẻ như họ chỉ xem xét sự vắng mặt / sự hiện diện của những con chó, mèo, v.v., chứ không phải sự phong phú của chúng.)

Có một bài kiểm tra thống kê để xác định điều này?

Tôi sẽ đồng tình với những gì đã được đề cập rằng Bray-Curtis có thể xử lý sự phong phú cũng như sự hiện diện / vắng mặt, cũng để thêm một cuốn sách hay khác vào hỗn hợp: Phân tích Cộng đồng Sinh thái của McCune và Grace.

Có rất nhiều yếu tố để xem xét khi bạn so sánh các cộng đồng sinh thái và tôi không nghĩ có một thử nghiệm duy nhất sẽ thực hiện công việc. Sự phù hợp của bài kiểm tra sẽ phụ thuộc rất nhiều vào loại câu hỏi bạn đang hỏi về cộng đồng và bản chất của bộ dữ liệu của bạn. Các cách tiếp cận phổ biến bao gồm các kỹ thuật phân phối, trong đó sắp xếp các vị trí trong một không gian phân loại đa chiều. Tuy nhiên nếu bạn thực sự chỉ có 2 trang thì điều này không có khả năng hoạt động. Các thử nghiệm thần chú tương quan với ma trận khoảng cách dựa trên thành phần (ví dụ: khoảng cách cặp Bray-Curtis trên tất cả các vị trí) với ma trận khoảng cách dựa trên các yếu tố ảnh hưởng tiềm năng khác. Trường hợp đơn giản nhất có thể chỉ là khoảng cách euclide giữa các vị trí trong không gian. Nhóm phân tích cụm trang web liên quan đến thành phần cộng đồng của họ.

Nói chung, tôi sẽ sử dụng một tập hợp con của nhiều công cụ thống kê được mô tả trong bất kỳ cuốn sách nào ở trên để cung cấp một mô tả thống kê về sự khác biệt giữa các cộng đồng trong câu hỏi. Không có thước đo duy nhất về sự khác biệt trong thành phần cộng đồng, vì vậy các số liệu thống kê được sử dụng để tổng hợp dữ liệu đa chiều thành một dạng dễ hiểu hơn.

EDIT: Tôi cũng chỉ nghĩ về bài báo này đưa ra nhiều lựa chọn khác nhau khá rõ ràng và kỹ lưỡng.

Anderson, MJ và cộng sự. 2011. Điều hướng nhiều ý nghĩa của đa dạng Beta: một lộ trình cho nhà sinh thái học thực hành. Thư sinh thái 14: 19-28

Nếu bạn muốn kiểm tra giả thuyết này, bạn có thể sử dụng Phân tích Tương tự (dựa trên Bray Curtis hoặc các phương thức khả dụng khác), có một quy trình có tên ANOSIM được thực hiện trong phần mềm PRIMER. Bạn có thể thực hiện phân tích Một chiều, lồng nhau hoặc Hai chiều. Một tùy chọn khác (tốt hơn) là chạy một phân tích đa phương thức hoán vị, một quy trình tốt có sẵn trong PERMANOVA thông thường (có sẵn tại http://www.stat.aogi.ac.nz/~mja/Programs.htm ) Một khi bạn đã kiểm tra sự khác biệt đáng kể giữa các trang web, bạn có thể theo dõi để biết loài nào có thể chịu trách nhiệm cho sự khác biệt quan sát được (thói quen IndVal hoặc thói quen SIMPER). hy vọng nó giúp

Vì bạn đề cập đến chỉ số Sorensen, có vẻ như bạn cần một số điểm không giống nhau hơn là một bài kiểm tra khác biệt. (Một điểm số sẽ cho một giá trị bằng số cho biết mức độ khác nhau của chúng. Một bài kiểm tra sẽ cho bạn biết sự khác biệt có ý nghĩa với một xác suất nhất định hay không.)

Bạn có thể đại diện cho sự phong phú của loài tại mỗi địa điểm bằng một biểu đồ. Biểu đồ này có thể được chuẩn hóa nếu bạn chỉ quan tâm đến sự phong phú tương đối (ví dụ: mèo có số lượng gấp đôi so với chó) hoặc không bình thường nếu bạn cũng quan tâm đến số lượng tuyệt đối.

Có nhiều cách để đo lường sự khác biệt của biểu đồ. Một số trong những phổ biến là:

• Thống kê Chi bình phương
• Khoảng cách L2
• Biểu đồ khoảng cách giao lộ

Bray-Curtis và các chỉ số tương tự khác kết hợp sự khác biệt về sự phong phú của loài. Ngoài Legendre và Legendre, tôi cũng muốn giới thiệu cuốn sách của Charles Krebs, Ecological Methology (1999).