Khoa học tính toán c

17

Có một bộ giải lập trình phi tuyến chất lượng cao cho Python không?

Tôi có một số vấn đề tối ưu hóa toàn cầu không lồi để giải quyết. Hiện tại tôi sử dụng Hộp công cụ tối ưu hóa của MATLAB (cụ thể là fmincon()với thuật toán = 'sqp'), khá hiệu quả . Tuy nhiên, hầu hết mã của tôi là bằng …

77 python optimization nonlinear-programming linear-algebra linear-solver sparse-matrix ode automatic-differentiation efficiency matrix symbolic-computation pde multiphysics operator-splitting fluid-dynamics pde multigrid pde hyperbolic-pde quadrature precision numerical-analysis fluid-dynamics interpolation c ode testing data-sets pde fluid-dynamics hyperbolic-pde pde finite-element fluid-dynamics stability incompressible pde hyperbolic-pde fluid-dynamics pde precision floating-point convex-optimization conditioning pde hyperbolic-pde stability implicit-methods explicit-methods fluid-dynamics accuracy pde hyperbolic-pde petsc linear-algebra

6

Trình biên dịch Fortran thực sự tốt hơn bao nhiêu?

Câu hỏi này là phần mở rộng của hai cuộc thảo luận được đưa ra gần đây trong phần trả lời " C ++ vs Fortran cho HPC ". Và đó là một chút thách thức hơn là một câu hỏi ... Một trong những lập luận thường được nghe …

74 fortran c blas benchmarking

17

Có phổ biến không sử dụng các thư viện cho các thuật toán số tiêu chuẩn, và tại sao?

Rất nhiều thuật toán số (tích hợp, phân biệt, nội suy, các hàm đặc biệt, v.v.) có sẵn trong các thư viện tính toán khoa học như GSL . Nhưng tôi thường thấy mã với các triển khai "cuộn tay" của các hàm này. Đối với các chương trình nhỏ …

54 libraries c

8

Phân tích dữ liệu cấu trúc protein trong C

Nền tảng của tôi là về genomics, nhưng gần đây tôi đã làm việc với các vấn đề liên quan đến cấu trúc protein. Tôi đã viết một vài chương trình có liên quan trong C, xây dựng trình phân tích cú pháp tệp PDB của riêng tôi từ đầu …

17 computational-biology pdb c

3

Chiến lược I / O cho các vấn đề tính toán với các tập dữ liệu lớn?

Nhóm nghiên cứu của tôi tập trung vào động lực phân tử, rõ ràng có thể tạo ra hàng gigabyte dữ liệu như một phần của một quỹ đạo mà sau đó phải được phân tích. Một số vấn đề chúng tôi quan tâm liên quan đến mối tương quan …

15 python c efficiency

5

Tính

Hàm có số ít gần . Điểm kỳ dị đó có thể được nâng lên, mặc dù: với , người ta nên có , vì Và do đó Tuy nhiên, hình thức không chỉ không được xác định tại , nó cũng không ổn định về số lượng trong vùng …

13 c++ c

4

C có chậm hơn Fortran trong loạt bắn định mức phổ (sử dụng gcc, intel và các trình biên dịch khác) không?

Kết luận ở đây: Trình biên dịch Fortran thực sự tốt hơn bao nhiêu? là gfortran và gcc nhanh như mã đơn giản. Vì vậy, tôi muốn thử một cái gì đó phức tạp hơn. Tôi lấy ví dụ về tiêu chuẩn loạt đá luân lưu. Trước tiên, tôi xác …

13 fortran c

1

Có một công cụ nào đó có thể tạo ra các phần mở rộng khoảng thời gian của các hàm Fortran (hoặc C) bằng cách phân tích mã Fortran (hoặc C) không?

Các nghiên cứu điển hình trong luận án tiến sĩ của tôi yêu cầu tôi có các phần mở rộng giữa các chương trình con Fortran trong CHEMKIN-II (xin lỗi về liên kết; đây là cách tốt nhất tôi có thể tìm thấy cho một gói không còn được phân …

13 fortran c automatic-differentiation interval-arithmetic

2

Có một bộ giải pháp ODE mã nguồn mở cho C sử dụng loại phức C99 nguyên gốc không?

Tôi đã sử dụng GSL làm nền tảng cho nhiều mô phỏng của mình, nhưng nó hơi quá mức cho mục đích của tôi và nó xác định loại phức tạp của riêng nó vì lý do di sản. Thay vì viết mã bộ giải Runge-Kutta ODE của riêng tôi, …

12 c ode

3

Kiểm tra nếu hai ma trận 12x12 có cùng định thức

12×1212×1212 \times 12QQQJdet(Q)=det(12I−Q−J)(1)det(Q)=det(12I−Q−J)(1)\det(Q) = \det(12I-Q-J) \; \; (1)JJJ Tôi hiện đang làm điều này với thư viện armadillo nhưng hóa ra quá chậm. Vấn đề là tôi cần phải làm điều này cho hàng nghìn tỷ ma trận và hóa ra việc tính toán hai yếu tố quyết định là …

11 linear-algebra matrix c++ graph-theory c

4

Tìm kiếm thứ tự Runge-Kutta thứ 8 trong C / C ++

Tôi muốn sử dụng phương pháp bậc 8 Runge-Kutta (89) trong ứng dụng cơ học thiên thể / astrodynamics, được viết bằng C ++, sử dụng máy Windows. Vì vậy, tôi tự hỏi nếu có ai biết một thư viện / triển khai tốt được ghi lại và sử dụng …

10 c++ reference-request libraries c runge-kutta

3

Các khuyến nghị cho một bộ giải đại số tuyến tính dày đặc dựa trên C / C ++

Hầu hết các chương trình của tôi là mã nghiên cứu một lần trong C để sử dụng riêng. Tôi chưa bao giờ phân phối bất kỳ mã nào ngoài các cộng tác viên thân thiết. Tôi đã phát triển một thuật toán mà tôi đang xuất bản trong một …

9 linear-solver libraries c++ c

3

Làm thế nào để tôi biết nếu mã của tôi đang được trình biên dịch vector hóa?

Như được minh họa bằng câu trả lời của Jed Brown về Chi phí tra cứu so với tính toán , sử dụng các phép toán dấu phẩy động được vectơ so với không được vector hóa dẫn đến mã nhanh hơn nhiều. Nhiều trình biên dịch hiện đại tuyên …

9 fortran c compiling vectorization

2

Tôi có nên chuyển đối số dòng lệnh cho MPI_Init hay không?

Khi viết mã MPI 3.0, tôi có nên chuyển argcvà argvthực hiện MPI_Initcuộc gọi hay không, và tại sao? EDIT: Vì câu trả lời của Bill Barth đã đưa ra một số câu hỏi tôi muốn đưa ra một số nhận xét: Đạt argc/ argvkhông bắt buộc kể từ MPI …

8 c++ c mpi

1

Thế hệ số giả ngẫu nhiên

Tôi đã sử dụng MT19937trong khai thác thử nghiệm để tạo các giá trị 32 bit [0, - 1] thống nhất, dựa trên triển khai mt19937.c của Tác giả ban đầu , để tạo ra nguồn cung cấp ngẫu nhiên (về cơ bản là vô tận) của các octet bit. …

8 performance c random-number-generation

Câu hỏi được gắn thẻ «c»