Khoa học tính toán

5

Có một trình giải CFD mã nguồn mở tốt, dễ sử dụng, chất lượng cao không?

Luận án của tôi là về việc phát triển các phương pháp số để giảm mô hình trong quá trình đốt cháy. Tôi chạy các phương pháp của mình hoàn toàn trên phần hóa học của mô phỏng đốt cháy, và tôi có rất nhiều nghiên cứu trường hợp cho …

17 pde fluid-dynamics software parallel-computing

5

Trạng thái của hệ điều hành Mac trong tính toán khoa học và HPC

Quay trở lại buổi bình minh của OS X, dường như có rất nhiều hubbub, ít nhất là trong thế giới Mac (lúc đó tôi không ở gần máy tính khoa học) về Mac OS như một nền tảng cho các ứng dụng khoa học và ứng dụng HPC. XGrid …

17 software hpc

4

Định nghĩa của hệ thống ODE cứng

Hãy xem xét IVP cho hệ thống ODE , . Thông thường nhất, sự cố này được coi là cứng khi ma trận Jacobi part part có cả giá trị riêng với phần thực âm rất lớn và giá trị riêng với phần thực âm rất nhỏ (tôi chỉ coi …

17 ode stiffness

4

Thực hành tốt nhất phân bổ / khởi tạo bộ nhớ đa điểm / NUMA

Khi các tính toán giới hạn băng thông bộ nhớ được thực hiện trong môi trường bộ nhớ dùng chung (ví dụ: luồng qua OpenMP, Pthreads hoặc TBB), có một vấn đề nan giải là làm thế nào để đảm bảo rằng bộ nhớ được phân phối chính xác trên …

17 performance memory-management multicore

3

Phần mềm máy tính để bàn với tài nguyên HPC cho crunching số cuối

Nhóm làm việc của chúng tôi tạo ra một ứng dụng máy tính để bàn mô phỏng hiệu suất năng lượng của tòa nhà. Nó là một ứng dụng .NET và khi người dùng đang chạy rất nhiều mô phỏng, chúng có thể khá tốn thời gian. Các mô phỏng …

17 hpc partitioning

8

Phân tích dữ liệu cấu trúc protein trong C

Nền tảng của tôi là về genomics, nhưng gần đây tôi đã làm việc với các vấn đề liên quan đến cấu trúc protein. Tôi đã viết một vài chương trình có liên quan trong C, xây dựng trình phân tích cú pháp tệp PDB của riêng tôi từ đầu …

17 computational-biology pdb c

6

Làm thế nào để xác định nhóm điểm của một phân tử?

Cuối cùng bạn đã tìm ra cách các nguyên tử được sắp xếp không gian trên thực thể phân tử mới được phát hiện của bạn. Thông qua các phương tiện quang phổ, giờ đây bạn đang sở hữu một loạt các tọa độ nguyên tử, các loại nguyên tử, …

17 computational-chemistry

2

Tôi nên học phiên bản nào của Fortran?

Tôi là sinh viên ngành Cơ khí quan tâm đến lĩnh vực kỹ thuật hàng không vũ trụ, theo tôi, Fortran vẫn được sử dụng phổ biến. Phiên bản nào của Fortran tôi nên đầu tư thời gian để tìm hiểu?

17 fortran

2

Galerkin không liên tục: Ưu điểm và nhược điểm của Nodal vs Modal

Có hai cách tiếp cận chung để biểu diễn các giải pháp trong phương pháp galerkin không liên tục: nốt và phương thức. Phương thức : Các giải pháp được đại diện bởi số tiền của hệ số phương thức nhân với một tập hợp các đa thức, ví dụ …

17 fluid-dynamics discontinuous-galerkin

3

C ++ Thực tiễn tốt nhất để xử lý nhiều hằng số, biến trong mã khoa học

Tôi đang phát triển một mã để mô phỏng dòng chất lỏng với các chất sinh học có trong dòng chảy. Điều này liên quan đến các phương trình Navier - Stokes tiêu chuẩn kết hợp với một số mô hình sinh học bổ sung. Có nhiều tham số / …

17 c++

2

Kích thước tệp nhị phân so với ASCII

Tôi cần phải viết một số dữ liệu từ một tính toán, sẽ được đọc sau bởi Paraview (tệp .vtu hoặc vtk). Khi nói đến kích thước tệp, tôi nên sử dụng định dạng ASCII hoặc định dạng nhị phân?

17 visualization paraview vtk

3

Các triển khai BLAS có được đảm bảo để đưa ra kết quả chính xác không?

Đưa ra hai cách triển khai BLAS khác nhau, chúng ta có thể hy vọng rằng chúng thực hiện các phép tính điểm chính xác giống nhau và trả về cùng kết quả không? Hoặc nó có thể xảy ra, ví dụ, rằng một tính một sản phẩm vô hướng …

17 floating-point blas

4

Tại sao các phương pháp Runge tầm Kutta bậc cao không được sử dụng thường xuyên hơn?

Tôi chỉ tò mò về lý do tại sao các phương pháp bậc cao (nghĩa là lớn hơn 4) hầu như không bao giờ được thảo luận / sử dụng (ít nhất là theo hiểu biết của tôi). Tôi hiểu rằng nó đòi hỏi thời gian tính toán trên mỗi …

17 ode runge-kutta

5

20% hiệu suất phạt cho một thiết kế phần mềm đẹp

Tôi đang viết một thư viện nhỏ để tính toán ma trận thưa thớt như một cách để dạy bản thân sử dụng tốt nhất việc lập trình hướng đối tượng. Tôi đã làm việc rất chăm chỉ để có một mô hình đối tượng đẹp, trong đó các phần …

17 linear-algebra sparse-matrix oop

4

Các GPU hiện có có hỗ trợ số học dấu phẩy động chính xác kép không?

Tôi đã chạy mã động lực phân tử (MD) GROMACS trên cụm Ubuntu Linux bao gồm các nút chứa 24 CPU Intel Xeon. Điểm quan tâm đặc biệt của tôi hóa ra hơi nhạy cảm với độ chính xác số học dấu phẩy động, vì vậy tôi đã phải chạy …

17 hpc floating-point molecular-dynamics gpu