Câu hỏi được gắn thẻ «computational-chemistry»

Gần đây tôi đã gặp một công thức của hiện tượng meta : " hai là dễ, ba là khó " (theo cách này của Federico Poloni), có thể được mô tả, như sau: Khi một vấn đề nhất định được hình thành cho hai thực thể, nó tương đối …

29 linear-algebra  computational-physics  computational-geometry  computational-chemistry 

Cuối cùng bạn đã tìm ra cách các nguyên tử được sắp xếp không gian trên thực thể phân tử mới được phát hiện của bạn. Thông qua các phương tiện quang phổ, giờ đây bạn đang sở hữu một loạt các tọa độ nguyên tử, các loại nguyên tử, …

17 computational-chemistry 

Tôi đọc về khoa học tính toán trên Wikipedia, nhưng sự hiểu biết của tôi không rõ ràng lắm. Liệu khoa học tính toán có liên quan đến lập trình? Khoa học tính toán khác với tính toán _ ____ như thế nào , trong đó khoảng trống có thể …

16 computational-chemistry  education 

Cụ thể, tôi muốn gia hạn công việc liên quan đến B3LYP bắt đầu với Gaussian 03 nhưng tiếp tục với GAMESS-US. Các năng lượng được cung cấp bởi các phương thức B3LYP mặc định không giống nhau. Có một cuộc thảo luận về điều này trong hướng dẫn GAMESS-US …

15 computational-chemistry  density-functional-theory 

Chính xác là gì? Bạn có thể giải thích khi nào cần thiết và tại sao?

15 computational-chemistry  basis-set 

Có trường hợp nào mà Hartree-Fock không phải là một phép tính gần đúng để tính toán hình học cân bằng khi phân tử ở trong điều kiện không phá vỡ liên kết?

14 computational-chemistry  hartree-fock 

Protein thường được biểu diễn dưới dạng phim hoạt hình, với β tờ dưới dạng mũi tên và xoắn ốc dưới dạng cuộn: Tôi đang tự hỏi, có nơi nào tham khảo mô tả việc xây dựng đại diện này không? Đó là, những đối tượng toán học nào được …

12 computational-chemistry  visualization 

Tôi mới lập trình và tôi đang cố gắng giải quyết vấn đề lớn đầu tiên của mình và viết chương trình lớn đầu tiên của mình. Tôi đã tìm kiếm các ví dụ mã nguồn mở để học hỏi, nhưng cho đến nay chỉ tìm thấy mã bằng các …

12 computational-chemistry  python  visualization 

Có một thuật toán liệt kê các biểu đồ tương ứng với một số phần tử Delaunay của các điểm trong 3D không? Nếu vậy, có một tham số hiệu quả của hình học tương ứng với bất kỳ "biểu đồ Delaunay" nào không? Tôi đang tìm cách liệt kê …

12 algorithms  computational-chemistry  delaunay-triangulation 

Tôi đang tạo ra hình ảnh 1d và 2d bằng Matlab ngay bây giờ để so sánh độ chính xác với một mô hình nhất định. Tôi cần so sánh các phương pháp của mình với mô hình Gaussian .wfn tiêu chuẩn và tôi sẽ làm điều đó bằng cách …

11 matlab  computational-chemistry  publications 

Tôi muốn hình dung một rung động phân tử không phải là một chế độ bình thường. Tôi muốn trình bày một biểu diễn tĩnh, vectơ của chuyển động, và tôi muốn một chút linh hoạt trong kiểu vectơ (kích thước, màu sắc, v.v.). Tôi cũng quan tâm đến việc …

11 computational-chemistry 

Trong phương pháp trường tự ổn định của Hartree - Fock để giải phương trình Schroedinger điện tử độc lập với thời gian, chúng tôi tìm cách giảm thiểu năng lượng trạng thái cơ bản, , của một hệ thống electron trong trường ngoài đối với sự lựa chọn quỹ …

10 computational-chemistry  iterative-method  convergence  hartree-fock 

Một số bộ cơ sở được cho là "nhất quán tương quan". Nó có ý nghĩa gì trong thực tế?

10 computational-chemistry  basis-set 

Tôi đang cố gắng mô hình dẫn nhiệt trong một xi lanh gỗ bằng các phương pháp khác biệt ngầm định. Phương trình nhiệt chung mà tôi đang sử dụng cho hình dạng hình trụ và hình cầu là: Trong đó p là hệ số hình dạng, p = 1 …

8 matlab  matrix  finite-difference  computational-chemistry  implicit-methods 

Tôi muốn kiểm tra ảnh hưởng của các tham số hòa tan trong các mô hình hòa tan ngầm và tự hỏi mã nào có sẵn miễn phí dưới dạng chương trình độc lập để gấp protein của protein nhỏ và sử dụng phương pháp giảm thiểu năng lượng thay …

8 computational-chemistry  computational-biology