Khoa học tính toán

4

Làm thế nào để đối phó với quá nhiều dữ liệu?

Mô phỏng động lực học plasma của chúng tôi thường tạo ra quá nhiều thông tin. Trong quá trình mô phỏng, chúng tôi ghi lại các thuộc tính vật lý khác nhau trên lưới (x, y, z, t) lớn bằng (8192x1024x1024x1500), cho ít nhất 10 thuộc tính. Thông tin này …

14 performance io data-management

1

Có một thuật toán đa biến giải quyết các vấn đề Neumann và có tốc độ hội tụ độc lập với số lượng cấp độ không?

Các phương pháp multigrid thường giải quyết các vấn đề Dirichlet ở các cấp độ (ví dụ: điểm Jacobi hoặc Gauss-Seidel). Khi sử dụng các phương pháp phần tử hữu hạn liên tục, việc lắp ráp các vấn đề Neumann nhỏ sẽ tốn kém hơn nhiều so với lắp ráp …

14 pde multigrid

3

Tại sao bộ giải song song của tôi chậm hơn bộ giải tuần tự của tôi?

Tôi đã chơi xung quanh với PETSc và nhận thấy rằng khi tôi chạy chương trình của mình với nhiều hơn một quy trình thông qua MPI, nó dường như chạy chậm hơn ! Làm thế nào tôi có thể kiểm tra để xem những gì đang xảy ra?

14 linear-algebra petsc

3

Thực hành tốt nhất để mô tả các mô hình dựa trên đại lý

Tôi làm việc khá nhiều về sinh học toán học / dịch tễ học, trong đó hầu hết các công việc khoa học mô hình hóa / tính toán vẫn bị chi phối bởi các bộ ODE, đôi khi phải thừa nhận các bộ khá phức tạp của chúng. Một …

14 ode computational-biology

1

Độ phức tạp của mô phỏng MD

Tôi chưa quen với mô phỏng động lực phân tử (MD). Sự phức tạp của một mô phỏng động lực phân tử về thời gian mô phỏng là gì? Nói cách khác, nếu tôi muốn tăng thời gian mô phỏng từ 10 nano giây lên 20 nano giây, tôi có …

14 molecular-dynamics complexity

3

Có phải Hartree-Fock luôn là một xấp xỉ tốt cho hình học phân tử và không phá vỡ liên kết?

Có trường hợp nào mà Hartree-Fock không phải là một phép tính gần đúng để tính toán hình học cân bằng khi phân tử ở trong điều kiện không phá vỡ liên kết?

14 computational-chemistry hartree-fock

4

Phần mềm nhanh nhất (nguồn mở) để giải quyết vấn đề lập trình số nguyên hỗn hợp là gì

Tôi có một vấn đề lập trình số nguyên hỗn hợp. Và tôi hiện đang sử dụng GLPK làm người giải quyết. Nhưng tôi thấy rằng GLPK tốt cho vấn đề Lập trình tuyến tính, nhưng đối với lập trình Integer Integer, nó đòi hỏi thời gian lâu hơn nhiều, …

14 optimization software linear-programming mixed-integer-programming

1

Các trường đại học nổi tiếng về vật lý tính toán

Tôi rất quan tâm đến vật lý tính toán và thật vui khi nghiên cứu những chủ đề này. Vì tôi dự định đi học một học kỳ ở nước ngoài, tôi đã tự hỏi những trường đại học nào được biết đến với vật lý tính toán? Đặc biệt …

14 education

2

Tại sao một nhà khoa học tính toán cần phải thực hiện phiên bản std :: phức tạp của riêng họ?

Nhiều thư viện C ++ nổi tiếng trong khoa học tính toán như Eigen , Trilinos và deal.II sử dụng đối tượng thư viện tiêu đề mẫu C ++ tiêu chuẩn std::complex<>, để biểu diễn các số dấu phẩy động phức tạp. Trong Jack Poulson của câu trả lời cho …

14 linear-algebra c++ programming-paradigms complex

1

Làm cách nào để xác định khoảng thời gian của trình tạo số giả ngẫu nhiên?

Giả sử tôi đang sử dụng một trình tạo số giả ngẫu nhiên tuyến tính (PRNG). Cho hạt giống , hệ số nhân (a), hệ số dịch chuyển (c) và hệ số mô đun (m), làm cách nào tôi có thể xác định thời gian PRNG của mình? Tôi có …

14 random-number-generation

2

Tùy chọn để giải quyết các hệ thống ODE trên GPU?

Tôi muốn đưa ra các hệ thống giải quyết ODE trên GPU, trong một cài đặt 'song song tầm thường'. Ví dụ, thực hiện phân tích độ nhạy với 512 bộ thông số khác nhau. Lý tưởng nhất là tôi muốn giải quyết ODE bằng bộ giải thời gian thích …

14 ode gpu

1

Các hướng dẫn để thực hiện các thí nghiệm tính toán là gì?

Vật lý, sinh học, hóa học, vv có các bộ quy tắc khác nhau để thực hiện các thí nghiệm: những sự kiện nào được coi là có liên quan, làm thế nào để tránh ô nhiễm mẫu, cách tạo và sửa chữa quy trình sao chép, v.v. Các tiêu …

13 benchmarking reproducibility experiment

4

Nhanh chóng xác định liệu một ma trận dày đặc có thứ hạng thấp hay không

Trong một dự án phần mềm mà tôi đang làm việc, một số tính toán nhất định dễ dàng hơn rất nhiều cho các ma trận thứ hạng thấp dày đặc. Một số trường hợp vấn đề liên quan đến ma trận thứ hạng thấp dày đặc, nhưng chúng được …

13 linear-algebra matrix lapack rank matrix-factorization

2

Tính toán tất cả các giá trị riêng của một ma trận kề kề rất lớn và rất thưa thớt

Tôi có hai biểu đồ với gần n ~ 100000 nút mỗi. Trong cả hai biểu đồ, mỗi nút được kết nối với chính xác 3 nút khác nên ma trận kề là đối xứng và rất thưa thớt. Cái khó là tôi cần tất cả giá trị riêng của …

13 linear-algebra sparse-matrix eigenvalues matrix

1

Sự hội tụ không đơn điệu trong bài toán điểm cố định

Lý lịch Tôi đang giải một biến thể của phương trình Ornstein-Zernike từ lý thuyết lỏng. Tóm lại, bài toán có thể được biểu diễn dưới dạng giải bài toán điểm cố định , trong đó là toán tử tích phân đại số và là hàm giải pháp (hàm tương …

13 iterative-method convergence