Câu hỏi được gắn thẻ «bioinformatics»

Tôi đang tìm kiếm các tài nguyên (hướng dẫn, sách giáo khoa, webcast, v.v.) để tìm hiểu về Markov Chain và HMM. Nền tảng của tôi là một nhà sinh vật học, và tôi hiện đang tham gia vào một dự án liên quan đến tin sinh học. Ngoài ra, …

57 references  markov-process  hidden-markov-model  bioinformatics 

Tôi tự hỏi nếu nó làm cho một sự khác biệt trong việc giải thích cho dù chỉ phụ thuộc, cả phụ thuộc và độc lập, hoặc chỉ các biến độc lập được chuyển đổi nhật ký. Hãy xem xét trường hợp log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Tôi …

46 regression  data-transformation  interpretation  regression-coefficients  logarithm  r  dataset  stata  hypothesis-testing  contingency-tables  hypothesis-testing  statistical-significance  standard-deviation  unbiased-estimator  t-distribution  r  functional-data-analysis  maximum-likelihood  bootstrap  regression  change-point  regression  sas  hypothesis-testing  bayesian  randomness  predictive-models  nonparametric  terminology  parametric  correlation  effect-size  loess  mean  pdf  quantile-function  bioinformatics  regression  terminology  r-squared  pdf  maximum  multivariate-analysis  references  data-visualization  r  pca  r  mixed-model  lme4-nlme  distributions  probability  bayesian  prior  anova  chi-squared  binomial  generalized-linear-model  anova  repeated-measures  t-test  post-hoc  clustering  variance  probability  hypothesis-testing  references  binomial  profile-likelihood  self-study  excel  data-transformation  skewness  distributions  statistical-significance  econometrics  spatial  r  regression  anova  spss  linear-model 

Phân phối nhị thức âm (NB) được xác định trên các số nguyên không âm và có hàm khối lượng xác suấtCó ý nghĩa gì khi xem xét phân phối liên tục trên các thực không âm được xác định bởi cùng một công thức (thay thế bằng )? Hệ …

24 distributions  negative-binomial  count-data  continuous-data  bioinformatics 

Tôi biết câu hỏi / tiêu đề của tôi không cụ thể lắm, vì vậy tôi sẽ cố gắng làm rõ nó: Mạng lưới thần kinh nhân tạo có thiết kế tương đối nghiêm ngặt. Tất nhiên, nhìn chung, chúng bị ảnh hưởng bởi sinh học và cố gắng xây …

24 machine-learning  neural-networks  bioinformatics  artificial-intelligence  neuroscience 

Gần đây, tôi đọc hai bài báo. Đầu tiên là về lịch sử của mối tương quan và thứ hai là về phương pháp mới gọi là Hệ số thông tin tối đa (MIC). Tôi cần sự giúp đỡ của bạn để hiểu phương pháp MIC để ước tính mối …

20 correlation  nonparametric  bioinformatics  information-theory  mutual-information 

Tôi có một bộ dữ liệu kiểm tra mất cân bằng cao. Tập hợp tích cực bao gồm 100 trường hợp trong khi tập hợp âm bao gồm 1500 trường hợp. Về mặt đào tạo, tôi có một nhóm ứng viên lớn hơn: bộ đào tạo tích cực có 1200 …

16 machine-learning  classification  data-mining  svm  bioinformatics 

Phân phối nhị thức âm tính đã trở thành một mô hình phổ biến cho dữ liệu đếm (cụ thể là số lần đọc trình tự dự kiến ​​trong một khu vực nhất định của bộ gen từ một thí nghiệm nhất định) trong tin sinh học. Giải thích khác …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Đây là một câu hỏi ngây thơ từ một người bắt đầu học máy học. Tôi đang đọc những cuốn sách "Học máy: Một viễn cảnh thuật toán" từ Marsland. Tôi thấy nó hữu ích như một cuốn sách giới thiệu, nhưng bây giờ tôi muốn đi sâu vào các …

14 machine-learning  clustering  bioinformatics 

Gần đây tôi đã tốt nghiệp thạc sĩ về mô hình y học và sinh học, đi kèm với toán kỹ thuật làm nền tảng. Mặc dù chương trình giáo dục của tôi bao gồm một số lượng đáng kể các khóa học về thống kê toán học (xem danh …

13 mathematical-statistics  bioinformatics  computational-statistics 

Hy vọng ai đó trên các diễn đàn này có thể giúp tôi giải quyết vấn đề cơ bản này trong các nghiên cứu biểu hiện gen. Tôi đã thực hiện trình tự sâu của một thí nghiệm và mô điều khiển. Sau đó tôi đã thu được các giá …

13 r  genetics  bioinformatics  microarray  biostatistics 

Bối cảnh sinh học Theo thời gian, một số loài thực vật có xu hướng nhân đôi toàn bộ bộ gen của chúng, thu được một bản sao bổ sung của mỗi gen. Do sự không ổn định của thiết lập này, nhiều gen trong số này sau đó bị …

11 generalized-linear-model  contingency-tables  fishers-exact  genetics  bioinformatics 

Tôi có một GLMM có dạng: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Khi tôi sử dụng drop1(model, test="Chi"), tôi nhận được kết quả khác với nếu tôi sử dụng Anova(model, type="III")từ gói xe hơi hoặc summary(model). Hai cái sau cho cùng một …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Chúng tôi luôn nói rằng số liệu thống kê chỉ là xử lý dữ liệu. Nhưng chúng ta cũng biết rằng tin học cũng đang có được kiến ​​thức từ phân tích dữ liệu. Ví dụ, người tin sinh học hoàn toàn có thể đi mà không cần thống kê …

10 bioinformatics 

Tại sao một người sử dụng tuổi và bình phương tuổi như là đồng biến trong một nghiên cứu liên kết di truyền? Tôi có thể hiểu việc sử dụng tuổi nếu nó được xác định là đồng biến quan trọng, nhưng tôi không biết gì về việc sử dụng …

10 multiple-regression  polynomial  predictor  bioinformatics  genetics 

Ví dụ: Tôi có một câu trong mô tả công việc: "Kỹ sư cao cấp Java ở Anh". Tôi muốn sử dụng một mô hình học tập sâu để dự đoán nó thành 2 loại: English và IT jobs. Nếu tôi sử dụng mô hình phân loại truyền thống, nó …

9 machine-learning  deep-learning  natural-language  tensorflow  sampling  distance  non-independent  application  regression  machine-learning  logistic  mixed-model  control-group  crossover  r  multivariate-analysis  ecology  procrustes-analysis  vegan  regression  hypothesis-testing  interpretation  chi-squared  bootstrap  r  bioinformatics  bayesian  exponential  beta-distribution  bernoulli-distribution  conjugate-prior  distributions  bayesian  prior  beta-distribution  covariance  naive-bayes  smoothing  laplace-smoothing  distributions  data-visualization  regression  probit  penalized  estimation  unbiased-estimator  fisher-information  unbalanced-classes  bayesian  model-selection  aic  multiple-regression  cross-validation  regression-coefficients  nonlinear-regression  standardization  naive-bayes  trend  machine-learning  clustering  unsupervised-learning  wilcoxon-mann-whitney  z-score  econometrics  generalized-moments  method-of-moments  machine-learning  conv-neural-network  image-processing  ocr  machine-learning  neural-networks  conv-neural-network  tensorflow  r  logistic  scoring-rules  probability  self-study  pdf  cdf  classification  svm  resampling  forecasting  rms  volatility-forecasting  diebold-mariano  neural-networks  prediction-interval  uncertainty